EpidemioR

Atenção: Este material está em contínuo desenvolvimento. Sugestões, contribuições e críticas são bem vindas. Apenas use os conjuntos de dados disponíveis nesse material com expressa permissão dos pesquisadores responsáveis.

Apresentação

O objetivo do epidemioR é fazer a documentação do uso do software R no desenvolvimento, aplicação e avaliação métodos para análise de dados em epidemiologia para manejo de doenças em plantas com temas específicos de interesse dos professores, pesquisadores e alunos.

De forma geral, são vistas abordagens de análise que vão da aplicação do R para análise de progresso temporal e espacial de doenças, estudo de dispersão de inóculo, modelagem e previsão de epidemias, análises multivariadas, análise de regressão múltipla e regressão não linear, dentre outros conforme demanda. Procura-se, sem que haja distanciamento dos objetivos da pesquisa, inovar no emprego de métodos estatísticos para que haja melhor aproveitamento dos dados, o que se consegue principalmente com: apropriadas visualizações gráficas, métodos de análise contemporâneos e apropriados às características da investigação e produção de código aberto e reproduzível.

A ênfase do curso é sobre problemas, delineamentos e abordagens de análise comuns à área epidemiológica como aqueles com medidas repetidas no tempo e experimentos realizados em vários anos e locais, também àqueles que avaliem tempo até um desfecho (inoculação, esporulação), dados de proporção (germinação, etc), dados de curva de crescimento (modelos não lineares) e análise de dados de avaliação de doença (incidência e severidade).

Este material é produzido devido à colaboração de professores e alunos do Programa de Pós Graduação em Produção Vegetal, com colaboração de professores e pesquisadores externos.