2 Dados de doenças de plantas em R

Os dados de doenças de plantas, são comumente armazenados em planilhas, em que cada linha corresponde às linhas de plantas nos talhões e cada coluna corresponde às plantas nas linhas. Além disso, mais de uma avaliação pode ter sido feita. Definimos algumas classes para representação em R, mas existem outras classes em outros pacotes de estatística espacial, tais como geoR (Ribeiro Jr. & Diggle 2001), splancs (Rowlingson, Diggle, adapted, packaged for R by Roger Bivand, pcp functions by Giovanni Petris & goodness of fit by Stephen Eglen 2006) ou sp (Pebesma & Bivand 2005).

Uma funcionalidade implementada, foi a importação de dados de arquivos texto:

2.1 Validação de dados

Alguns procedimentos fizeram-se necessários:

1. Troca utilizando a função change.code():
   
     > table(dat2 <- change.code(dat1, ori = c("O", "G"), mod = c(0,
     +     0)))
   
         0     1     2     3     F     R
     11101  6897  1363  4292    94   253
2. Seleção utilizando a funcão select.code():
   
     > table(dat3 <- select.code(dat2, unselect = c("F", "R")))
   
         0     1     2     3
     11079  6897  1363  4286
3. Validação temporal, função validStatusMSC.citrus():
   
     > table(dat4 <- validStatusMSC.citrus(dat3, corr = TRUE))
   
     9  inconsistences in  25 evaluations of 945 plants.
     
         0     1     2     3
     11079  6897  1363  4286

2.2 Descrição de dados de doenças em plantas

Método summary() para as três primeiras avaliações:

O método table():

O método table(), usando proporções:

O método plot() produz um mapa para uma avaliação especificada.

O método lines():