R para pesquisa científica
Detalhes da oferta da disciplina
- Curso: PPG Ecologia e Conservação
- Período: 3 a 7 de fevereiro de 2020
- Professor Responsável: Fernando de Pol Mayer, (LEG: Laboratório de Estatística e Geoinformação)
- Horários e Locais: Segunda a sexta, 14:00 - 18:00h, sala 421, Departamento de Botânica
- Avaliação: elaboração de um documento dinâmico (reproduzível) contendo análises, tabelas e gráficos
Descrição
Estudos recentes mostram que cientistas passam cerca de 30% de seu tempo escrevendo códigos. No entanto, mais de 90% deles são primariamente auto-didatas, e portanto carecem de exposição à princípios básicos de programação e boas práticas de computação científica, o que facilitaria o desenvolvimento de suas pesquisas.
Esse curso tem a intenção de preencher essa lacuna, por meio da exposição de conceitos fundamentais de programação na linguagem R. Também serão demonstradas algumas práticas em computação científica, com a intenção de otimizar o tempo despendido em programação. Além disso, algumas ferramentas disponíveis no R serão utilizadas com a finalidade de tornar uma pesquisa reproduzível.
O público alvo do curso são alunos de pós-graduação que já utilizam o R (em qualquer nível) em suas pesquisas, mas desejam aprofundar seu conhecimento nos fundamentos do R e utilizar suas ferramentas para pesquisa reproduzível. Estudantes sem nenhum conhecimento no R são bem vindos, mas poderão ter alguma dificuldade no acompanhamento.
Ementa
Funções e argumentos. Objetos, classes e métodos. Indexação e seleção condicional. Importação e exportação de dados. Programação: estruturas de controle e repetição; criação de funções; família de funções apply. Boas práticas para computação científica. Pesquisa reproduzível. Linguagens de marcação: LaTeX e Markdown. Documentos dinâmicos com knitr e Rmarkdown. Personalização de documentos dinâmicos.
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