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Diferenças
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dicas:lcpad [2009/04/16 11:03] paulojus |
dicas:lcpad [2009/04/16 11:36] paulojus |
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|---|---|---|---|
| Linha 25: | Linha 25: | ||
| * É possível rodar aplicativos gráficos na servidora ''lcpad.ufpr.br'' mas não nas demais. | * É possível rodar aplicativos gráficos na servidora ''lcpad.ufpr.br'' mas não nas demais. | ||
| * Todas as servidoras utilizam uma área de usuário (conta) comum. A área dos usuários da estatística é sempre da forma ''/home/users/est/LOGIN'' | * Todas as servidoras utilizam uma área de usuário (conta) comum. A área dos usuários da estatística é sempre da forma ''/home/users/est/LOGIN'' | ||
| - | * O LCPAD utiliza o interpretador de comandos //ZSHELL//. Par amais detalhes [[lcpad#shell|ver sessão SHELL ]] abaixo. | + | * O LCPAD utiliza o interpretador de comandos //ZSHELL//. Para mais detalhes [[lcpad#shell|ver sessão SHELL]] abaixo. |
| + | |||
| + | //Sugestão:// | ||
| + | * usar a servidora ''lcpad.ufpr.br'' para sessões interativas e/ou ''jobs'' rápidos | ||
| + | * usar as demais para ''jobs'' mais longos e/ou múltiplos ''jobs'' | ||
| + | * Existem diversas máquinas adicionais (ver saida do comando ''normas'') tais como ''a01-a10'', ''h01-h04'', ''o01-o03'' (**dentre outras**). para acessar uma delas use o ''rlogin''<code> | ||
| + | lcpad % rlogin a03 | ||
| + | a03 % | ||
| + | </code> | ||
| + | * para ver a lista de máquinas disponíveis digite em ''lcpad'':<code> | ||
| + | % carga | ||
| + | </code> | ||
| ==== Uso do R no LCPAD ==== | ==== Uso do R no LCPAD ==== | ||
| Linha 44: | Linha 56: | ||
| % Rnox CMD BATCH seu_programa.R & | % Rnox CMD BATCH seu_programa.R & | ||
| </code> | </code> | ||
| - | |||
| Linha 54: | Linha 65: | ||
| Existem diferentes estratégias para contornar isto: | Existem diferentes estratégias para contornar isto: | ||
| - | - Mudar o seu //shell// para o ''bash'' | + | - Mudar o seu //shell// para o ''bash'' ([[lcpad#shell|ver sessão SHELL]] abaixo) |
| - | - Utilizar ''disown'' ou ''nohup'' no //zshel// como nos exemplos a seguir (válido tanto para uso do ''R'' quanto ''Rnox''). | + | - Utilizar ''disown'' ou ''nohup'' no //zshel// como nos exemplos a seguir (válido tanto para uso do ''R'' quanto ''Rnox'')<code> |
| - | : </code> | + | |
| a02% Rnox CMD BATCH ap.R & | a02% Rnox CMD BATCH ap.R & | ||
| a02% disown % | a02% disown % | ||
| Linha 65: | Linha 75: | ||
| </code> | </code> | ||
| - | No caso do ''Rpj'' esta última solução pode ser ''automatizada mudando o seu //alias// em ''.zshrc'' para: | + | No caso do ''Rnox'' esta última solução pode ser //automatizada// mudando o seu //alias// em ''.zshrc'' para:<code> |
| - | <code> | + | |
| alias Rnox="nice -n 19 nohup /home/users/est/paulojus/R/bin/R" | alias Rnox="nice -n 19 nohup /home/users/est/paulojus/R/bin/R" | ||
| source .zshrc | source .zshrc | ||
| Linha 86: | Linha 95: | ||
| </code> | </code> | ||
| + | |||
| + | ==== Acompanhando seus processo ==== | ||
| + | - No ''R'' sugere-se sempre colocar no seu programa comandos ''print()'' (por exmeplo imprimir o número da simulação) que permitam que voce acompanhe o andamento com <code> | ||
| + | % tail -f sau_programa.Rout | ||
| + | </code> | ||
| + | - Numa náuqina voce pode ver se o processo está rodando com um dos seguintes comandos do linux: <code> | ||
| + | % ps -u SEU_LOGIN | ||
| + | % top | ||
| + | </code> | ||
| + | - O LCPAD disponibiliza ainda comandos para acompanha processos:<code> | ||
| + | % carga | ||
| + | % carga -u | ||
| + | % carga -U | ||
| + | % carga -j | ||
| + | </code> | ||
| + | * A primeira forma mostra o //load// das máquinas. (útil para escolher em qual máquina está menos carregada submeter o próximo //job//), | ||
| + | * a segunda mostra o número total de processos que o usuário está rodando em cada máquina, | ||
| + | * a terceira mostra o número de processos do usuário que efetivamente consomem cpu. | ||
| + | * a quarta sintaxe mostra o nome dos programas daquele usuário rodando em cada máquina. | ||
| ==== Finalmente .... ==== | ==== Finalmente .... ==== | ||
