disciplinas:verao2007

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--- disciplinas:verao2007 [2007/01/02 17:23]
paulojus
+++ disciplinas:verao2007 [2007/02/12 12:57]
paulojus
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   * **Horários e Locais**
     * Terças: 16:00 às 18:00 (B-139)
-    * Quartas: 16:00 às 18:00 (CEC-6)
+    * Quartas: 14:00 às 16:00 (B-139) e 16:00 às 18:00 (CEC-6)
     * Quintas: 10:00 às 12:00 (B-139)
   * **Ministrante** Prof. [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo]] Justiniano Ribeiro Jr, [[http://www.leg.ufpr.br|LEG]]: Laboratório de Estatística e Geoinformação, [[http://www.ufpr.br|UFPR]]
-===== Conteúdo semanal (sujeito a ajustes durante o curso) =====
+===== Conteúdo (sujeito a ajustes durante o curso) =====
-No que se segue //Capítulos// se refere ao livro texto do curso (Diggle & Ribeiro, 2007)
+No que se segue //Capítulos// se refere ao livro texto do curso ([[http://www.springer.com/west/home/generic/search/results?SGWID=4-40109-22-173660039-0|Diggle & Ribeiro, 2007]]).
-  - **Semana 1**:
+Veja aqui o {{disciplinas:verao2007:toc.txt|Índice}} de conteúdo deste texto.
-    * Teóricas: Capítulo 1
-    * Práticas: Recursos computacionais: R, R-Spatial, geoR, geoRglm
-  - **Semana 2**:
-    * Teóricas:
-    * Práticas:
-  - **Semana 3**:
-    * Teóricas:
-    * Práticas:
-  - **Semana 4**:
-    * Teóricas:
-    * Práticas:
-  - **Semana 5**:
-    * Teóricas:
-    * Práticas:
-  - **Semana 6**:
-    * Teóricas:
-    * Práticas:
-===== Bibliografia =====
+Materiais do curso:
-**Livro texto do curso**:
+  * {{disciplinas:pdf:aula1.pdf|Aula 1}} sobre estatística espacial
-<bibtex>
+  * {{disciplinas:pdf:verao.pdf|Geoestatística}} (atualizações periódicas)
-@Book{diggle+ribeiro:2007,
+  * {{disciplinas:pdf:rongelapgambia.pdf|Estudos de Caso}}: dados de Rongelap e Gâmbia
-  author = 	 {Diggle, P. J. and {Ribeiro Jr.}, P. J.},
+  * os dados utilizados nos exemplos, aulas práticas e exercícios estão disponíveis na [[http://www.leg.ufpr.br/geoR|geoR]] e/ou [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/datasets/|neste link]].
-  ALTeditor = 	 {},
+  * os tutoriais mencionados nas práticas e exercícios fazem parte da [[http://www.leg.ufpr.br/geoR/geoRdoc/tutorials.html|sessão de tutoriais]] da página da ''geoR''
-  title = 	 {Model-based Geostatistics},
+=== Semana 1 (03-04/01) ===
-  publisher = 	 {Springer},
+    * Teóricas: Introdução a estatística espacial. Tipos de problemas de estatística espaciais e idéias básicas para análise e modelagem. Geoestatística: problemas básicos e alguns exemplos que serão usados neste curso (Capítulo 1)
-  year = 	 {2007}}
-</bibtex>
-\\
-**Referências adicionais**:
-<bibtex>
-@InProceedings{diggle+ribeiro+christensen:2003,
-  author = 	 {Diggle, P. J. and {Ribeiro Jr}, P. J. and Christensen, O. F.},
-  title = 	 {An introduction to model-based geostatistics},
-  booktitle = 	 {Spatial Statistics and Computational Methods},
-  OPTcrossref =  {},
-  OPTkey = 	 {},
-  pages = 	 {43--86},
-  year = 	 {2003},
-  editor = 	 {M{\o}ller, J.},
-  OPTaddress = 	 {New York},
-  OPTmonth = 	 {},
-  OPTorganization = {},
-  publisher =    {Springer},
-  OPTnote = 	 {},
-  OPTannote = 	 {}
-}
-@Article{diggle+tawn+moyeed:1998,
-  author = 	 {Diggle, P. J. and Tawn, J. A. and Moyeed, R. A.},
-  title = 	 {Model based geostatistics (with Discussion)},
-  journal = 	 JRSSC,
-  year = 	 {1998},
-  volume = 	 {47},
-  OPTnumber = 	 {3},
-  pages = 	 {299--350},
-}
-@Book{stein:1999,
-  author = 	 {Stein, M. L.},
-  title = 	 {Interpolation of Spatial Data: Some Theory for Kriging},
-  publisher = 	 {Springer},
-  address = 	 {New York},
-  year = 	 {1999},
-}
-</bibtex>
-\\
+    * Prática: Apresentação e introdução ao uso dos recursos computacionais a serem utilizados neste curso: R, R-Spatial, geoR, geoRglm. (ver links no final desta página).
-<bibtex>
+      - neste primeira semana foi dada ênfase no entendimento da estrutura e uso do sistema R e seus pacotes
-@Book{shabenberger+gotway:2005,
+      - [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/verao/lab1|Um tutorial]] que fornece informações sobre o uso dos recursos do R para estatística espacial e ilustra algumas técnicas de análise para diferentes tipos de dados espaciais.
-  author = 	 {Oliver Shabenberger and Carol A. Gotway},
+    * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 1|Exercícios]]
-  ALTeditor = 	 {},
-  title = 	 {Statistical methods for spatial data analysis},
-  publisher = 	 {Chapman \& Hall/CRC},
-  year = 	 {2005},
-  OPTkey = 	 {},
-  OPTvolume = 	 {},
-  OPTnumber = 	 {},
-  OPTseries = 	 {},
-  OPTaddress = 	 {},
-  OPTedition = 	 {},
-  OPTmonth = 	 {},
-  OPTnote = 	 {},
-  OPTannote = 	 {}
-}
-@Book{bailey+gatrell:1996,
-  author =	 {Bailey, T. C. and Gatrell, A. C.},
-  title =	 {Interactive Spatial Data Analysis},
-  publisher =	 {Longman},
-  address =	 {Harlow},
-  year =	 {1996},
-}
-@Book{banerjee+carlin+gelfand:2004,
-  author =	 {Banerjee, S. and Carlin, B. P. and Gelfand, A. E.},
-  title =	 {Hierachical Modelling and Analysis for spatial Data},
-  publisher =	 {Chapman and Hall},
-  address =	 {Boca Raton},
-  year =	 {2004},
-}
-@Book{cressie:1993,
-  author = 	 {Cressie, N.},
-  title = 	 {Statistics for Spatial Data},
-  publisher = 	 {Wiley},
-  address = 	 {New York},
-  year = 	 {1993},
-}
-@Book{ripley:1981,
-  author = 	 {Ripley, B. D.},
-  title = 	 {Spatial Statistics},
-  publisher = 	 {Wiley},
-  address = 	 {New York},
-  year = 	 {1981},
-}
-</bibtex>
-\\
+=== Semana 2 (9-11/01)===
-<bibtex>
+    * Teóricas: uma visão geral de geoestatística (Capítulo 2) e modelos gaussianos para dados geoestatísticos (Capítulo 3)
-@Book{kitanidis:1997,
+      - {{disciplinas:r:chapter2.r|Arquivo com os comandos}} utilizados no Capítulo 2 de Diggle & Ribeiro (2007)
-  author = 	 {Kitanidis, P.},
+    * Práticas: ferramentas para análise exploratória geoestatística, funções básicas para análise, simulação de dados
-  title = 	 {Introduction to Geostatistics: applications in hydrogeology},
+      - Visite [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/explora.R|este tutorial]], reproduza as análises e explore os comandos e funcionalidades com os dados fornecidos e/ou seus próprios dados.
-  publisher = 	 {Cambridge University Press},
+      - idem para [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/ctc.R|este outro tutorial]] que mostra análises de dados de CTC do solo. A CTC é uma medida de fertilidade de solos.
-  address = 	 {New York},
+    * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 2|Exercícios]]
-  year = 	 {1997},
-}
-@Book{goovaerts:1997,
-  author = 	 {Goovaerts, P.},
-  title = 	 {Geostatistics for Natural Resources Evaluation},
-  publisher = 	 {Oxford University Press},
-  address = 	 {New York},
-  year = 	 {1997},
-}
-@Book{isaaks+srivastava:1989,
-  author = 	 {Isaaks, E. H. and Srisvastava, R. M.},
-  title = 	 {An Introduction to Applied Geostatistics},
-  publisher = 	 {Oxford University Press},
-  address = 	 {New York},
-  year = 	 {1989},
-}
-@Book{wackernagel:2003,
-  author = 	 {Wackernagel, H.},
-  title = 	 {Multivariate geostatistics: an Introduction with applications.},
-  publisher = 	 {Springer},
-  OPTaddress = 	 {},
-  address = 	 {Berlin},
-  year = 	 {2003},
-  OPTkey = 	 {},
-  OPTseries = 	 {},
-  edition = 	 {3rd},
-  OPTannote = 	 {ISBN 3-540-44142-5}
-}
-</bibtex>
-\\
+=== Semana 3 (16-18/01)===
-<bibtex>
+    * Teóricas: Estimação de parâmetros (Capítulo 5, exceto Seção 5.5) e Predição Espacial (Capítulo 6)
-@Book{le+zidek:2006,
+    * Práticas: O objetivo desta sessão é explorar as funcionalidades para estivação de parâmetros do modelo geoestatístico. Visite o tutoriais abaixo, reproduza, discuta e interprete as análises. Neste ponto voce pode ignorar a parte de predição espacial (//krigagem//)
-  author = 	 {Nhu D. Le and James V. Zidek},
+      - [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/Rcruciani.R|dados de condutividade hidráulica do solo]]
-  ALTeditor = 	 {},
+      - [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/aula050819.R|outras análises deste e de ouitros dados]]
-  title = 	 {Statistical analysis of environmental space-time process},
+    * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 3|Exercícios]]
-  publisher = 	 {Springer},
-  year = 	 {2006},
-  OPTkey = 	 {},
-  OPTvolume = 	 {},
-  OPTnumber = 	 {},
-  OPTseries = 	 {},
-  OPTaddress = 	 {},
-  OPTedition = 	 {},
-  OPTmonth = 	 {},
-  OPTnote = 	 {},
-  OPTannote = 	 {}
-}
-@Book{rue+held:2005,
-  author = 	 {Rue, H. and Held, L.},
-  title = 	 {Gaussan Markov Random Fields: Theory and Applications},
-  publisher = 	 {Chapman and Hall},
-  year = 	 {2005},
-  address = 	 {London},
-}
-@Book{diggle:2003,
-  author = 	 {Diggle, P. J.},
-  title = 	 {Statistical Analysis of Spatial Point Patterns},
-  publisher = 	 {Edward Arnold},
-  address = 	 {London},
-  edition =      {Second},
-  year = 	 {2003},
-}
-@Book{moller+waagepetersen:2004,
-  author = 	 {M{\o}ller, J. and Waagepetersen, R. P.},
-  ALTeditor = 	 {},
-  title = 	 {Statistical Inference and Simulation for Spatial Point Processes},
-  publisher = 	 {Chapman and Hall/CRC},
-  year = 	 {2004},
-  OPTkey = 	 {},
-  OPTvolume = 	 {},
-  OPTnumber = 	 {},
-  OPTseries = 	 {},
-  OPTaddress = 	 {},
-  OPTedition = 	 {},
-  OPTmonth = 	 {},
-  OPTnote = 	 {},
-  OPTannote = 	 {}
-}
-</bibtex>
-\\
+=== Semana 4 (23-24/01)===
-<bibtex>
+    * Teóricas: Modelos lineares generalizados geoestatísticos (Capítulo 4) e inferência (Seção 5.5) e Inferência Bayesiana para modelos geoestatísticos lineares e lineares generalizados (Capítulo 7)
-@Book{lawson:2001,
+    * Práticas: O objetivo desta prática é explorar a implementação no pacote ''geoR'' de inferência Bayesiana para modelos Gaussianos. Para isto recomenda-se a análise de dados já vistos anteriormente utilizando a função ''krige.bayes()''.
-  author = 	 {Andrew B. Lawson},
+    * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 4|Exercícios]]
-  title = 	 {Statistical methods in spatial epidemiology},
-  publisher = 	 {John Wiley \& Sons},
+=== Semana 5 (30-31/01 e 01/02) ===
-  year = 	 {2001},
+    * Teóricas: Estudos de casos: exemplos comentados e detalhados de análise de dados ([[disciplinas:verao2007:semana5|veja os arquivos utilizados e editados]])
-  OPTkey = 	 {},
+    * Práticas: o objetivo é efetuar análises de GLGM utilizando o pacote [[http://www.leg.ufpr.br/geoRglm|geoRglm]].
-  OPTvolume = 	 {},
+      - Visite a página do pacote e inspecione a documentação disponível
-  OPTnumber = 	 {},
+      - simule um conjunto de dados de um GLGM
-  OPTseries = 	 {},
+      - use algorítmos da geoRglm para obter estimativas de parametros via //MCMC-likelihood//
-  OPTaddress = 	 {},
+      - idem para inferência a predição Bayesianas
-  OPTedition = 	 {},
+    * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 5|Exercícios]]
-  OPTmonth = 	 {},
-  OPTnote = 	 {},
+=== Semana 6 ===
-  OPTannote = 	 {}
+    * Teóricas: Mais estudos de casos em GLGM. Extensões do modelo: sobrevivência espacial, processos pontuais, processos pontuais marcados. Delineamentos geoestatísticos (Capítulo 8).
-}
+    * Práticas: Análise de dados do trabalho do curso.
-@Book{waller+gotway:2004,
-  author = 	 {Waller, L. A. and Gotway, C. A. },
+=== Semana 7 ===
-  ALTeditor = 	 {},
+    * Teóricas: Algumas alternativas para modelagem espaço temporal. Tópicos adicionais em estatística espacial: fundamentos de cartografia e SIG, processos pontuais e dados de áreas. O Pacote ''aRT''
-  title = 	 {Applied Spatial Statistics for Public Health Data},
+    * Práticas: Análise de dados do trabalho do curso.
-  publisher = 	 {Wiley},
-  address =      {New York},
-  year = 	 {2004},
+===== Bibliografia =====
-  OPTkey = 	 {},
+[[disciplinas:verao2007:bibliografia|Esta lista]] possui diversas referências bibliográficas separadas pelos tipos de assunto cobertos pelos textos.
-  OPTvolume = 	 {},
-  OPTnumber = 	 {},
-  OPTseries = 	 {},
+===== Espaço Aberto =====
-  OPTaddress = 	 {},
+[[disciplinas:verao2007:aberto|Página aberta]] a edição para participantes do curso.
-  OPTedition = 	 {},
-  OPTmonth = 	 {},
-  OPTnote = 	 {},
-  OPTannote = 	 {}
-}
-</bibtex>
 ===== Links =====
@@ Linha 254: / Linha 78: @@
   - [[http://wiki.r-project.org/rwiki|R Wiki]]: principal Wiki do R (em Inglês).
   - [[http://leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa|Um curso sobre o uso do R]]
-  - [[http://sourceforge.net/projects/tinn-r|Tinn-R]] GUI/Editor para o ambiente [[http://www.r-project.org/|R]] sob Windows (se é que voce **ainda** usa este sistema operacional ...).
+  - [[http://sourceforge.net/projects/tinn-r|Tinn-R]] GUI/Editor (disponível apenas para o ambiente [[http://www.r-project.org/|R]] sob Windows).
   - [[http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Views/Spatial.html|R Spatial]] task view and R-SIG-Geo resources
   - [[http://www.leg.ufpr.br/geoR|geoR web page]]
   - [[http://www.leg.ufpr.br/geoRglm|geoRglm web page]]
   - [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo's web page]]

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