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disciplinas:verao2007 [2007/01/06 23:34] paulojus |
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===== Conteúdo (sujeito a ajustes durante o curso) ===== | ===== Conteúdo (sujeito a ajustes durante o curso) ===== | ||
- | No que se segue //Capítulos// se refere ao livro texto do curso (Diggle & Ribeiro, 2007) | + | No que se segue //Capítulos// se refere ao livro texto do curso ([[http://www.springer.com/west/home/generic/search/results?SGWID=4-40109-22-173660039-0|Diggle & Ribeiro, 2007]]). |
- | === Semana 1 === | + | Veja aqui o {{disciplinas:verao2007:toc.txt|Índice}} de conteúdo deste texto. |
+ | |||
+ | Materiais do curso: | ||
+ | * {{disciplinas:pdf:aula1.pdf|Aula 1}} sobre estatística espacial | ||
+ | * {{disciplinas:pdf:verao.pdf|Geoestatística}} (atualizações periódicas -- última versão 10/01/2007, 09:45 AM) | ||
+ | * os dados utilizados nos exemplos, aulas práticas e exercícios estão disponíveis na [[http://www.leg.ufpr.br/geoR|geoR]] e/ou [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/datasets/|neste link]]. | ||
+ | * os tutoriais mencionados nas práticas e exercícios fazem parte da [[http://www.leg.ufpr.br/geoR/geoRdoc/tutorials.html|sessão de tutoriais]] da página da ''geoR'' | ||
+ | === Semana 1 (03-04/01) === | ||
* Teóricas: Introdução a estatística espacial. Tipos de problemas de estatística espaciais e idéias básicas para análise e modelagem. Geoestatística: problemas básicos e alguns exemplos que serão usados neste curso (Capítulo 1) | * Teóricas: Introdução a estatística espacial. Tipos de problemas de estatística espaciais e idéias básicas para análise e modelagem. Geoestatística: problemas básicos e alguns exemplos que serão usados neste curso (Capítulo 1) | ||
- | {{disciplinas:pdf:aula1.pdf|Transparências aula 1}} e {{disciplinas:pdf:verao.pdf|transparências aula 2}} | ||
* Prática: Apresentação e introdução ao uso dos recursos computacionais a serem utilizados neste curso: R, R-Spatial, geoR, geoRglm. (ver links no final desta página). | * Prática: Apresentação e introdução ao uso dos recursos computacionais a serem utilizados neste curso: R, R-Spatial, geoR, geoRglm. (ver links no final desta página). | ||
- neste primeira semana foi dada ênfase no entendimento da estrutura e uso do sistema R e seus pacotes | - neste primeira semana foi dada ênfase no entendimento da estrutura e uso do sistema R e seus pacotes | ||
- [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/verao/lab1|Um tutorial]] que fornece informações sobre o uso dos recursos do R para estatística espacial e ilustra algumas técnicas de análise para diferentes tipos de dados espaciais. | - [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/verao/lab1|Um tutorial]] que fornece informações sobre o uso dos recursos do R para estatística espacial e ilustra algumas técnicas de análise para diferentes tipos de dados espaciais. | ||
- | * Exercícios: | + | * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 1|Exercícios]] |
- | === Semana 2 === | + | === Semana 2 (9-11/01)=== |
* Teóricas: uma visão geral de geoestatística (Capítulo 2) e modelos gaussianos para dados geoestatísticos (Capítulo 3) | * Teóricas: uma visão geral de geoestatística (Capítulo 2) e modelos gaussianos para dados geoestatísticos (Capítulo 3) | ||
+ | - {{disciplinas:r:chapter2.r|Arquivo com os comandos}} utilizados no Capítulo 2 de Diggle & Ribeiro (2007) | ||
* Práticas: ferramentas para análise exploratória geoestatística, funções básicas para análise, simulação de dados | * Práticas: ferramentas para análise exploratória geoestatística, funções básicas para análise, simulação de dados | ||
- | === Semana 3 === | + | - Visite [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/explora.R|este tutorial]], reproduza as análises e explore os comandos e funcionalidades com os dados fornecidos e/ou seus próprios dados. |
- | * Teóricas: Modelos lineares generalizados geoestatísticos (Capítulo 4) e estimação de parâmetros (Capítulo 5) | + | - idem para [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/ctc.R|este outro tutorial]] que mostra análises de dados de CTC do solo. A CTC é uma medida de fertilidade de solos. |
- | * Práticas: | + | * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 2|Exercícios]] |
- | === Semana 4 === | + | |
- | * Teóricas: Predição espacial (Capítulo 6) e Inferência Bayesiana (Capítulo 7) | + | === Semana 3 (16-18/01)=== |
- | * Práticas: | + | * Teóricas: Estimação de parâmetros (Capítulo 5, exceto Seção 5.5) e Predição Espacial (Capítulo 6) |
- | === Semana 5 === | + | * Práticas: O objetivo desta sessão é explorar as funcionalidades para estivação de parâmetros do modelo geoestatístico. Visite o tutoriais abaixo, reproduza, discuta e interprete as análises. Neste ponto voce pode ignorar a parte de predição espacial (//krigagem//) |
- | * Teóricas: Delineamentos geoestatísticos (Capítulo 8), algumas extensões (modelos multivariados e espaço temporais) e estudos de caso adicionais | + | - [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/Rcruciani.R|dados de condutividade hidráulica do solo]] |
- | * Práticas: | + | - [[http://leg.ufpr.br/geoR/tutorials/aula050819.R|outras análises deste e de ouitros dados]] |
+ | * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 3|Exercícios]] | ||
+ | |||
+ | === Semana 4 (23-24/01)=== | ||
+ | * Teóricas: Modelos lineares generalizados geoestatísticos (Capítulo 4) e inferência (Seção 5.5) e Inferência Bayesiana para modelos geoestatísticos lineares e lineares generalizados (Capítulo 7) | ||
+ | * Práticas: O objetivo desta prática é explorar a implementação no pacote ''geoR'' de inferência Bayesiana para modelos Gaussianos. Para isto recomenda-se a análise de dados já vistos anteriormente utilizando a função ''krige.bayes()''. | ||
+ | * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 4|Exercícios]] | ||
+ | |||
+ | === Semana 5 (30-31/01 e 01/02) === | ||
+ | * Teóricas: Estudo de caso: um exemplo de análise de dados ([[disciplinas:verao2007:semana5|veja os arquivos utilizados e editado]]) | ||
+ | * Práticas: o objetivo é efetuar análises de GLGM utilizando o pacote [[http://www.leg.ufpr.br/geoRglm|geoRglm]]. | ||
+ | - Visite a página do pacote e inspecione a documentação disponível | ||
+ | - simule um conjunto de dados de um GLGM | ||
+ | - use algorítmos da geoRglm para obter estimativas de parametros via //MCMC-likelihood// | ||
+ | - idem para inferência a predição Bayesianas | ||
+ | * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 5|Exercícios]] | ||
=== Semana 6 === | === Semana 6 === | ||
- | * Teóricas: tópicos adicionais em estatística espacial: fundamentos de cartografia e SIG, processos pontuais e dados de áreas | + | * Teóricas: Delineamentos geoestatísticos (Capítulo 8), algumas extensões (modelos multivariados e espaço temporais) e estudos de caso adicionais. |
* Práticas: | * Práticas: | ||
+ | * [[disciplinas:verao2007:exercicios#semana 6|Exercícios]] | ||
- | ===== Bibliografia ===== | + | === Semana 7 === |
- | **Livro texto do curso**: | + | * Teóricas: Tópicos adicionais em estatística espacial: fundamentos de cartografia e SIG, processos pontuais e dados de áreas |
- | <bibtex> | + | * Práticas: |
- | @Book{diggle+ribeiro:2007, | + | |
- | author = {Diggle, P. J. and {Ribeiro Jr.}, P. J.}, | + | |
- | ALTeditor = {}, | + | |
- | title = {Model-based Geostatistics}, | + | |
- | publisher = {Springer}, | + | |
- | year = {2007}} | + | |
- | </bibtex> | + | |
- | \\ | + | |
- | **Referências adicionais**: | + | |
- | <bibtex> | + | |
- | @InProceedings{diggle+ribeiro+christensen:2003, | + | |
- | author = {Diggle, P. J. and {Ribeiro Jr}, P. J. and Christensen, O. F.}, | + | |
- | title = {An introduction to model-based geostatistics}, | + | |
- | booktitle = {Spatial Statistics and Computational Methods}, | + | |
- | OPTcrossref = {}, | + | |
- | OPTkey = {}, | + | |
- | pages = {43--86}, | + | |
- | year = {2003}, | + | |
- | editor = {M{\o}ller, J.}, | + | |
- | OPTaddress = {New York}, | + | |
- | OPTmonth = {}, | + | |
- | OPTorganization = {}, | + | |
- | publisher = {Springer}, | + | |
- | OPTnote = {}, | + | |
- | OPTannote = {} | + | |
- | } | + | |
- | @Article{diggle+tawn+moyeed:1998, | + | |
- | author = {Diggle, P. J. and Tawn, J. A. and Moyeed, R. A.}, | + | |
- | title = {Model based geostatistics (with Discussion)}, | + | |
- | journal = JRSSC, | + | |
- | year = {1998}, | + | |
- | volume = {47}, | + | |
- | OPTnumber = {3}, | + | |
- | pages = {299--350}, | + | |
- | } | + | |
- | @Book{stein:1999, | + | |
- | author = {Stein, M. L.}, | + | |
- | title = {Interpolation of Spatial Data: Some Theory for Kriging}, | + | |
- | publisher = {Springer}, | + | |
- | address = {New York}, | + | |
- | year = {1999}, | + | |
- | } | + | |
- | </bibtex> | + | |
- | \\ | ||
- | <bibtex> | ||
- | @Book{shabenberger+gotway:2005, | ||
- | author = {Oliver Shabenberger and Carol A. Gotway}, | ||
- | ALTeditor = {}, | ||
- | title = {Statistical methods for spatial data analysis}, | ||
- | publisher = {Chapman \& Hall/CRC}, | ||
- | year = {2005}, | ||
- | OPTkey = {}, | ||
- | OPTvolume = {}, | ||
- | OPTnumber = {}, | ||
- | OPTseries = {}, | ||
- | OPTaddress = {}, | ||
- | OPTedition = {}, | ||
- | OPTmonth = {}, | ||
- | OPTnote = {}, | ||
- | OPTannote = {} | ||
- | } | ||
- | @Book{bailey+gatrell:1996, | ||
- | author = {Bailey, T. C. and Gatrell, A. C.}, | ||
- | title = {Interactive Spatial Data Analysis}, | ||
- | publisher = {Longman}, | ||
- | address = {Harlow}, | ||
- | year = {1996}, | ||
- | } | ||
- | @Book{banerjee+carlin+gelfand:2004, | ||
- | author = {Banerjee, S. and Carlin, B. P. and Gelfand, A. E.}, | ||
- | title = {Hierachical Modelling and Analysis for spatial Data}, | ||
- | publisher = {Chapman and Hall}, | ||
- | address = {Boca Raton}, | ||
- | year = {2004}, | ||
- | } | ||
- | @Book{cressie:1993, | ||
- | author = {Cressie, N.}, | ||
- | title = {Statistics for Spatial Data}, | ||
- | publisher = {Wiley}, | ||
- | address = {New York}, | ||
- | year = {1993}, | ||
- | } | ||
- | @Book{ripley:1981, | ||
- | author = {Ripley, B. D.}, | ||
- | title = {Spatial Statistics}, | ||
- | publisher = {Wiley}, | ||
- | address = {New York}, | ||
- | year = {1981}, | ||
- | } | ||
- | </bibtex> | ||
- | \\ | + | ===== Bibliografia ===== |
- | <bibtex> | + | [[disciplinas:verao2007:bibliografia|Esta lista]] possui diversas referências bibliográficas separadas pelos tipos de assunto cobertos pelos textos. |
- | @Book{chiles+delfiner:1999, | + | |
- | author = {Chil\`{e}s, J-P and Delfiner, P.}, | + | |
- | title = {Geostatistics: Modeling Spatial Uncertainty}, | + | |
- | publisher = {Wiley}, | + | |
- | address = {New York}, | + | |
- | year = {1999}, | + | |
- | } | + | |
- | @Book{kitanidis:1997, | + | |
- | author = {Kitanidis, P.}, | + | |
- | title = {Introduction to Geostatistics: applications in hydrogeology}, | + | |
- | publisher = {Cambridge University Press}, | + | |
- | address = {New York}, | + | |
- | year = {1997}, | + | |
- | } | + | |
- | @Book{goovaerts:1997, | + | |
- | author = {Goovaerts, P.}, | + | |
- | title = {Geostatistics for Natural Resources Evaluation}, | + | |
- | publisher = {Oxford University Press}, | + | |
- | address = {New York}, | + | |
- | year = {1997}, | + | |
- | } | + | |
- | @Book{isaaks+srivastava:1989, | + | |
- | author = {Isaaks, E. H. and Srisvastava, R. M.}, | + | |
- | title = {An Introduction to Applied Geostatistics}, | + | |
- | publisher = {Oxford University Press}, | + | |
- | address = {New York}, | + | |
- | year = {1989}, | + | |
- | } | + | |
- | @Book{wackernagel:2003, | + | |
- | author = {Wackernagel, H.}, | + | |
- | title = {Multivariate geostatistics: an Introduction with applications.}, | + | |
- | publisher = {Springer}, | + | |
- | OPTaddress = {}, | + | |
- | address = {Berlin}, | + | |
- | year = {2003}, | + | |
- | OPTkey = {}, | + | |
- | OPTseries = {}, | + | |
- | edition = {3rd}, | + | |
- | OPTannote = {ISBN 3-540-44142-5} | + | |
- | } | + | |
- | </bibtex> | + | |
- | \\ | ||
- | <bibtex> | ||
- | @Book{le+zidek:2006, | ||
- | author = {Nhu D. Le and James V. Zidek}, | ||
- | ALTeditor = {}, | ||
- | title = {Statistical analysis of environmental space-time process}, | ||
- | publisher = {Springer}, | ||
- | year = {2006}, | ||
- | OPTkey = {}, | ||
- | OPTvolume = {}, | ||
- | OPTnumber = {}, | ||
- | OPTseries = {}, | ||
- | OPTaddress = {}, | ||
- | OPTedition = {}, | ||
- | OPTmonth = {}, | ||
- | OPTnote = {}, | ||
- | OPTannote = {} | ||
- | } | ||
- | @Book{rue+held:2005, | ||
- | author = {Rue, H. and Held, L.}, | ||
- | title = {Gaussan Markov Random Fields: Theory and Applications}, | ||
- | publisher = {Chapman and Hall}, | ||
- | year = {2005}, | ||
- | address = {London}, | ||
- | } | ||
- | @Book{diggle:2003, | ||
- | author = {Diggle, P. J.}, | ||
- | title = {Statistical Analysis of Spatial Point Patterns}, | ||
- | publisher = {Edward Arnold}, | ||
- | address = {London}, | ||
- | edition = {Second}, | ||
- | year = {2003}, | ||
- | } | ||
- | @Book{moller+waagepetersen:2004, | ||
- | author = {M{\o}ller, J. and Waagepetersen, R. P.}, | ||
- | ALTeditor = {}, | ||
- | title = {Statistical Inference and Simulation for Spatial Point Processes}, | ||
- | publisher = {Chapman and Hall/CRC}, | ||
- | year = {2004}, | ||
- | OPTkey = {}, | ||
- | OPTvolume = {}, | ||
- | OPTnumber = {}, | ||
- | OPTseries = {}, | ||
- | OPTaddress = {}, | ||
- | OPTedition = {}, | ||
- | OPTmonth = {}, | ||
- | OPTnote = {}, | ||
- | OPTannote = {} | ||
- | } | ||
- | </bibtex> | ||
- | \\ | + | ===== Espaço Aberto ===== |
- | <bibtex> | + | [[disciplinas:verao2007:aberto|Página aberta]] a edição para participantes do curso. |
- | @Book{lawson:2001, | + | |
- | author = {Andrew B. Lawson}, | + | |
- | title = {Statistical methods in spatial epidemiology}, | + | |
- | publisher = {John Wiley \& Sons}, | + | |
- | year = {2001}, | + | |
- | OPTkey = {}, | + | |
- | OPTvolume = {}, | + | |
- | OPTnumber = {}, | + | |
- | OPTseries = {}, | + | |
- | OPTaddress = {}, | + | |
- | OPTedition = {}, | + | |
- | OPTmonth = {}, | + | |
- | OPTnote = {}, | + | |
- | OPTannote = {} | + | |
- | } | + | |
- | @Book{waller+gotway:2004, | + | |
- | author = {Waller, L. A. and Gotway, C. A. }, | + | |
- | ALTeditor = {}, | + | |
- | title = {Applied Spatial Statistics for Public Health Data}, | + | |
- | publisher = {Wiley}, | + | |
- | address = {New York}, | + | |
- | year = {2004}, | + | |
- | OPTkey = {}, | + | |
- | OPTvolume = {}, | + | |
- | OPTnumber = {}, | + | |
- | OPTseries = {}, | + | |
- | OPTaddress = {}, | + | |
- | OPTedition = {}, | + | |
- | OPTmonth = {}, | + | |
- | OPTnote = {}, | + | |
- | OPTannote = {} | + | |
- | } | + | |
- | </bibtex> | + | |
===== Links ===== | ===== Links ===== | ||
Linha 268: | Linha 78: | ||
- [[http://wiki.r-project.org/rwiki|R Wiki]]: principal Wiki do R (em Inglês). | - [[http://wiki.r-project.org/rwiki|R Wiki]]: principal Wiki do R (em Inglês). | ||
- [[http://leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa|Um curso sobre o uso do R]] | - [[http://leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa|Um curso sobre o uso do R]] | ||
- | - [[http://sourceforge.net/projects/tinn-r|Tinn-R]] GUI/Editor para o ambiente [[http://www.r-project.org/|R]] sob Windows (se é que voce **ainda** usa este sistema operacional ...). | + | - [[http://sourceforge.net/projects/tinn-r|Tinn-R]] GUI/Editor (disponível apenas para o ambiente [[http://www.r-project.org/|R]] sob Windows). |
- [[http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Views/Spatial.html|R Spatial]] task view and R-SIG-Geo resources | - [[http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Views/Spatial.html|R Spatial]] task view and R-SIG-Geo resources | ||
- [[http://www.leg.ufpr.br/geoR|geoR web page]] | - [[http://www.leg.ufpr.br/geoR|geoR web page]] | ||
- [[http://www.leg.ufpr.br/geoRglm|geoRglm web page]] | - [[http://www.leg.ufpr.br/geoRglm|geoRglm web page]] | ||
- [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo's web page]] | - [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo's web page]] | ||
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