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--- pessoais:eder [2011/04/23 17:19]
eder [section 1]
+++ pessoais:eder [2011/06/12 16:21]
eder [section 5]
@@ Linha 1: / Linha 1: @@
 ===== Éder David Borges da Silva =====
-  * Graduando em Engenharia Agronômica - [[http://www.agronomia.ufpr.br|Eng Agronômica - UFPR]]
+  * Graduado em Engenharia Agronômica - [[http://www.agronomia.ufpr.br|Eng Agronômica - UFPR]]
   * **e-mail:** ederdbs@gmail.com / eder@leg.ufpr.br
@@ Linha 11: / Linha 11: @@
   *  Estatística Experimental
   *  Estatística Espacial
-  * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/projetos:gem2|GEM²]] - em construção
+  * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/projetos:gem2|GEM²]] Grupo de estudos em modelos mistos
+===== Disciplinas 2011/1 =====
+  * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/disciplinas:ce210-2010-02|CE-210: Inferência estatística II]]
+  * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/disciplinas:ce718|CE-718: Métodos Computacionalmente Intensivos]]
 ===== Minicursos =====
    * [[http://www.leg.ufpr.br/ragronomia|Estatística Experimental com Software R]]
-   * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:eder:exptempo| Análise de Experimentos de longa duração]]
+   * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:eder:planejamentofito|Planejamento de experimento PG Produção Vegetal UFPR]]
+   * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:eder:exptempo| Análise de Experimentos de longa duração]] II Reunião Paranaense Ciência do Solo
+===== Códigos =====
+<code R>
+###-----------------------------------------------------------------###
+### Agulha de buffon
+buffon <- function(n,l=1,a=1){
+  if(a<l){cat('Erro: a < l, deve ser a > l\n')}
+  if(a>=l){
+  theta <- runif(n,0,pi)
+  dist <- runif(n,0,a/2)
+  inter <- sum(dist <= l/2*sin(theta))
+  phi_est <- round((n/inter)*(2*l/a),12)
+  cat('Número Simulação',n,'phi_estimado',phi_est,'Erro',round(pi-phi_est,12),'\n')
+  return(c(n,phi_est))
+}}
+n <- seq(10000,1000000,by=20000)
+res <- matrix(NA,ncol=2,nrow=length(n))
+con <- 1
+for (i in n){
+  res[con,] <- buffon(i)
+  con <- con+1
+}
+plot(res,type='l',ylab=expression(pi),xlab='Simulações')
+abline(h=pi,col='red')
+###-----------------------------------------------------------------###
+### MOnte carlo
+## Calcula a área via simulação de monte carlo
+## args: r= raio, s vetor com numero de simulação, plotS plotar a simulação
+MCcirculo<-function(r,s,plotS=TRUE){
+ns<-area<-s
+r<-r
+con <- 1
+for (j in ns) {
+#pontos aleatorios
+	x<-runif(j, min=-r, max=r)
+	y<-runif(j, min=-r, max=r)
+	ponto<-cbind(x,y)
+  cont <- sum(apply(ponto,1,function(x){sqrt(sum(x^2))})<r)
+#plotando Simulação
+  if(plotS==TRUE){
+	plot(x,y,col="red",type="p",asp=1,lwd=1,xlim=c(-r,r),ylim=c(-r,r), main="Simulação Monte Carlo",sub=j)
+	ang <- seq(0, 2*pi, length = 100)
+	xx <- r * cos(ang);yy <- r * sin(ang)
+	polygon(xx, yy,border = "dark blue",lwd=2)
+  }
+#Calculo de Area
+	area[con]<-(cont/j)*(r^2)*4
+  cat(paste(round(area[con],6),j,'\n'))
+  con <- con+1
+}
+	plot(ns,area,main="Simulação Monte Carlo",xlab='Número da amostra',ylab='Area')
+  abline(h=pi*r^2,col='red',lwd=2)
+}
+MCcirculo(1,seq(5,5000,by=1000),plotS=FALSE)
+###-----------------------------------------------------------------###
+### Inversão de Probabilidade
+### OBJ: gerar x~exp transformando de uma uniforme
+NS <- 10000
+lam <- 0.5
+#f(x)=exp(lam) F(x)=1-exp(-lam*x), logo: F^-1(x)= -lam^-1*log(1-x)
+Gexp <- function(x,lam){-(log(1-U))/lam}
+U <- runif(NS)
+X <- Gexp(U,lam)
+Y <- rexp(NS,lam)
+par(mfrow=c(1,3))
+hist(U,freq=FALSE,main='Uniforme',col='lightblue')
+lines(density(U),col='red',lwd=2)
+hist(X,freq=FALSE,main='Expoencial via uniforme',col='lightblue')
+lines(density(X),col='red',lwd=2)
+lines(curve(dexp(x,lam),min(X),max(X),add=TRUE),col='blue',lwd=2)
+hist(Y,freq=FALSE,main='Expoencial do R',col='lightblue')
+lines(density(Y),col='red',lwd=2)
+lines(curve(dexp(x,lam),min(Y),max(Y),add=TRUE),col='blue',lwd=2)
+###-----------------------------------------------------------------###
+### Metodos de integração numerica
+#Função
+f <- function(x){1/18*x^2}
+a <- -3
+b <- 3
+# Analiticamente
+(1/18*b^3/3)-(1/18*a^3/3)
+# integrar de -3,3
+x <- seq(a,b,l=100)
+plot(x,f(x),type='l')
+# Integração nativa do R - Gauss–Kronrod quadrature
+integrate(f,a,b)
+###Simpson 1/3 - INtervalos par, igualmente espaçados
+n <- 12
+xi <- seq(a,b,l=n+1)
+i <- seq(2,n,by=2)
+j <- seq(3,n-1,by=2)
+((b-a)/n/3)*(f(a)+4*sum(f(xi[i]))+2*sum(f(xi[j]))+f(b))
+###Simpson 3/8 - Intervalos divisiveis por 3
+n <- 12
+xi <- seq(a,b,l=n+1)
+i <- seq(2,n,by=3)
+j <- seq(4,n-2,by=3)
+((3*(b-a)/n)/8)*(f(a)+3*sum(f(xi[i])+f(xi[i+1]))+2*sum(f(xi[j]))+f(b))
+### Quadratura gausiana 3º Ordem
+w <- c(0.555555,0.888888,0.555555)
+xi <- c(-0.77459667,0,0.77459667)
+(b-a)/2*sum(f((b-a)/2*xi+(a+b)/2)*w)
+### Quadratura gausiana 6º Ordem
+w <- c(0.1713245,0.3607616,0.4679139,0.4679139,0.3607616,0.1713245)
+xi <- c(-0.933246951,-0.66120938,-0.23861919,0.23861919,0.66120938,0.933246951)
+(b-a)/2*sum(f((b-a)/2*xi+(a+b)/2)*w)
+###Monte Carlo
+n <- 1000
+xi <- runif(n,a,b)
+Ls <- max(f(seq(a,b,l=100)))
+Li <- min(f(seq(a,b,l=100)))
+yi <- runif(n,Li,Ls)
+sum(f(xi)>=yi)/n*((b-a)*(Ls-Li))
+points(xi,yi)
+###-----------------------------------------------------------------###
+### Regressão Beta
+### pacote oficial
+require(betareg)
+data("FoodExpenditure", package = "betareg")
+fe_beta <- betareg(I(food/income) ~ income + persons , data = FoodExpenditure)
+summary(fe_beta)
+###-----------------------------------------------------------------###
+### log vero da regressão beta com duas covariaveis,
+log.vero <- function(par,y,x1,x2){
+        mu <- exp((par[1] + par[2] * x1 + par[3] * x2))/(1+exp((par[1] + par[2] * x1 + par[3] * x2)))##logit^-1
+        ll  <- sum(dbeta(y, mu* par[4], (1-mu)*par[4],log = TRUE))
+        return(ll)
+}
+###-----------------------------------------------------------------###
+opt <- optim(c(B0=-0.5,B1=-0.51,B2=0.11,phi=35),log.vero,y=FoodExpenditure$food/FoodExpenditure$income,
+                                                        x1=FoodExpenditure$income,
+                                                        x2=FoodExpenditure$persons,
+                                                        hessian = TRUE, control=(list(fnscale=-1)))
+opt
+opt$par
+sqrt(-diag(solve(opt$hessian)))
+summary(fe_beta)
+###-----------------------------------------------------------------###
+</code>
-===== Planejamento e Análise de experimentos =====
+[[http://www.ime.usp.br/~sferrari/beta.pdf|Regressão beta]]
- == Material Geral do curso==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/CursoRFito.zip| Geral(Dados, Scripts...)]]
- == Revisão de Estatística Basica ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/RevisaoEstBasica.R| Script]]
- == Planejamento de Experimentos ==
-    *  [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/PlaneAnaExp.pdf| Apresentação]]
- == Introdução ao R ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/IntroducaoR.R| Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Introdu%e7%e3o%20ao%20Software%20R.pdf| Apresentação]]
- == Delineamento Inteiramente ao Acaso ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DIC/exemplo%20dic.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DIC/exemplo dic.xls|dados]]
- == Delineamento Blocos ao Acaso ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DBA/exemplo%20dba.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DBA/exemplo dba.xls|dados]]
- == Esquema Fatorial ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Fatorial/Fatorial.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Fatorial/fatorial2x3.txt|dados]]
- == Parcelas Sub-divididas ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/SubDividida/Subdividida.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/SubDividida/subdividida.txt|dados]]
- == Regressão ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Regressao/Regre.r|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Regressao/Escoamento.txt|dados]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Regressao.pdf|Apresentação]]
- == Script geral do curso ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Material%20SNW/Script.pdf| pdf]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Script.R|Script]]

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