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--- pessoais:eder [2011/06/01 22:31]
eder [Codigos]
+++ pessoais:eder [2011/06/06 20:39]
eder [section 5]
@@ Linha 12: / Linha 12: @@
   *  Estatística Espacial
   * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/projetos:gem2|GEM²]] Grupo de estudos em modelos mistos
+===== Disciplinas 2011/1 =====
+  * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/disciplinas:ce210-2010-02|CE-210: Inferência estatística II]]
+  * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/disciplinas:ce718|CE-718: Métodos Computacionalmente Intensivos]]
 ===== Minicursos =====
    * [[http://www.leg.ufpr.br/ragronomia|Estatística Experimental com Software R]]
-   * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:eder:exptempo| Análise de Experimentos de longa duração]]
+   * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:eder:planejamentofito|Planejamento de experimento PG Produção Vegetal UFPR]]
-===== Codigos =====
+   * [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:eder:exptempo| Análise de Experimentos de longa duração]] II Reunião Paranaense Ciência do Solo
+===== Códigos =====
 <code R>
-###buf
+###-----------------------------------------------------------------###
-buf <- function(n){
+buffon <- function(n,l=1,a=1){
-  ttt <- NULL
+  if(a<l){cat('Erro: a < l, deve ser a > l\n')}
-  ttt[1] <- 0
+  if(a>=l){
-  x <- runif(n)
+  theta <- runif(n,0,pi)
-  th <- runif(n,0,pi)
+  dist <- runif(n,0,a/2)
-  st <- sin(th)
+  inter <- sum(dist <= l/2*sin(theta))
-  for ( i in 1:n){
+  phi_est <- round((n/inter)*(2*l/a),12)
-    if(st[i]>x[i]){
+  cat('Número Simulação',n,'phi_estimado',phi_est,'Erro',round(pi-phi_est,12),'\n')
-      ttt[i+1]  <- ttt[i]+1
+  return(c(n,phi_est))
-    }
+}}
-    else {
-      ttt[i+1] <- ttt[i]
+n <- seq(10000,1000000,by=20000)
-    }}
+res <- matrix(NA,ncol=2,nrow=length(n))
-    if (ttt[n+1]>0){
+con <- 1
-      plot((0:n)[ttt>0],2*(0:n)[ttt>0]/ttt[ttt>0],type='l',xlab='numero simulação',ylab='pi')
+for (i in n){
-    }
+  res[con,] <- buffon(i)
-    else{print('no sucesso')}
+  con <- con+1
-    abline(pi,0)
+}
-    }
-  buf(100000)
+plot(res,type='l',ylab=expression(pi),xlab='Simulações')
+abline(h=pi,col='red')
+###-----------------------------------------------------------------###
 ### MOnte carlo
-### inversão de p
+## Calcula a área via simulação de monte carlo
-################################################################################
+## args: r= raio, s vetor com numero de simulação, plotS plotar a simulação
-### Regressão beta
+MCcirculo<-function(r,s,plotS=TRUE){
-rm(list=ls())
+ns<-area<-s
-require(betareg)
+r<-r
-###----------------------------------------------------------###
+con <- 1
+for (j in ns) {
+#pontos aleatorios
+	x<-runif(j, min=-r, max=r)
+	y<-runif(j, min=-r, max=r)
+	ponto<-cbind(x,y)
+  cont <- sum(apply(ponto,1,function(x){sqrt(sum(x^2))})<r)
+#plotando Simulação
+  if(plotS==TRUE){
+	plot(x,y,col="red",type="p",asp=1,lwd=1,xlim=c(-r,r),ylim=c(-r,r), main="Simulação Monte Carlo",sub=j)
+	ang <- seq(0, 2*pi, length = 100)
+	xx <- r * cos(ang);yy <- r * sin(ang)
+	polygon(xx, yy,border = "dark blue",lwd=2)
+  }
+#Calculo de Area
+	area[con]<-(cont/j)*(r^2)*4
+  cat(paste(round(area[con],6),j,'\n'))
+  con <- con+1
+}
+	plot(ns,area,main="Simulação Monte Carlo",xlab='Número da amostra',ylab='Area')
+  abline(h=pi*r^2,col='red',lwd=2)
+}
+MCcirculo(1,seq(5,5000,by=1000),plotS=FALSE)
+###-----------------------------------------------------------------###
+### Inversão de Probabilidade
+### OBJ: gerar x~exp transformando de uma uniforme
+NS <- 10000
+lam <- 0.5
+#f(x)=exp(lam) F(x)=1-exp(-lam*x), logo: F^-1(x)= -lam^-1*log(1-x)
+Gexp <- function(x,lam){-(log(1-U))/lam}
+U <- runif(NS)
+X <- Gexp(U,lam)
+Y <- rexp(NS,lam)
+par(mfrow=c(1,3))
+hist(U,freq=FALSE,main='Uniforme',col='lightblue')
+lines(density(U),col='red',lwd=2)
+hist(X,freq=FALSE,main='Expoencial via uniforme',col='lightblue')
+lines(density(X),col='red',lwd=2)
+lines(curve(dexp(x,lam),min(X),max(X),add=TRUE),col='blue',lwd=2)
+hist(Y,freq=FALSE,main='Expoencial do R',col='lightblue')
+lines(density(Y),col='red',lwd=2)
+lines(curve(dexp(x,lam),min(Y),max(Y),add=TRUE),col='blue',lwd=2)
+###-----------------------------------------------------------------###
+### Regressão Beta
 ### pacote oficial
+require(betareg)
 data("FoodExpenditure", package = "betareg")
 fe_beta <- betareg(I(food/income) ~ income + persons , data = FoodExpenditure)
 summary(fe_beta)
-###----------------------------------------------------------###
+###-----------------------------------------------------------------###
-### log vero
+### log vero da regressão beta com duas covariaveis,
-log.vero <- function(B0,B1,B2,phi,y,x1,x2){
+log.vero <- function(par,y,x1,x2){
-        mu <- exp((B0 + B1 * x1 + B2 * x2))/(1+exp((B0 + B1 * x1 + B2 * x2)))##logit^-1
+        mu <- exp((par[1] + par[2] * x1 + par[3] * x2))/(1+exp((par[1] + par[2] * x1 + par[3] * x2)))##logit^-1
-        ll  <- sum(dbeta(y, mu* phi, (1-mu)*phi,log = TRUE))
+        ll  <- sum(dbeta(y, mu* par[4], (1-mu)*par[4],log = TRUE))
         return(ll)
 }
-###----------------------------------------------------------###
-log.vero(-0.62,-0.12,0.11,35,y=FoodExpenditure$food/FoodExpenditure$income,
+###-----------------------------------------------------------------###
-                                                        x1=FoodExpenditure$income,
+opt <- optim(c(B0=-0.5,B1=-0.51,B2=0.11,phi=35),log.vero,y=FoodExpenditure$food/FoodExpenditure$income,
-                                                        x2=FoodExpenditure$persons)
-###----------------------------------------------------------###
-### B0 B1
-par.vals <- expand.grid(B0=seq(0,2,l=100),B1=seq(-1,1,l=100))
-logL <- apply(as.matrix(par.vals),1,log.vero,B2=0.11,phi=35,y=FoodExpenditure$food/FoodExpenditure$income,
-                                                        x1=FoodExpenditure$income,
-                                                        x2=FoodExpenditure$persons)
-contour(unique(par.vals$B0),unique(par.vals$B1),matrix(logL,ncol=100))
-###----------------------------------------------------------###
-opt <- optim(c(-0.5,-0.12,0.11,35),logvero,y=FoodExpenditure$food/FoodExpenditure$income,
                                                         x1=FoodExpenditure$income,
                                                         x2=FoodExpenditure$persons,
                                                         hessian = TRUE, control=(list(fnscale=-1)))
+opt
+opt$par
+sqrt(-diag(solve(opt$hessian)))
+summary(fe_beta)
+###-----------------------------------------------------------------###
 </code>
-[[http://www.ime.usp.br/~sferrari/beta.pdf|Regressão beta]]
-===== Planejamento e Análise de experimentos =====
+[[http://www.ime.usp.br/~sferrari/beta.pdf|Regressão beta]]
- == Material Geral do curso==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/CursoRFito.zip| Geral(Dados, Scripts...)]]
- == Revisão de Estatística Basica ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/RevisaoEstBasica.R| Script]]
- == Planejamento de Experimentos ==
-    *  [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/PlaneAnaExp.pdf| Apresentação]]
- == Introdução ao R ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/IntroducaoR.R| Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Introdu%e7%e3o%20ao%20Software%20R.pdf| Apresentação]]
- == Delineamento Inteiramente ao Acaso ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DIC/exemplo%20dic.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DIC/exemplo dic.xls|dados]]
- == Delineamento Blocos ao Acaso ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DBA/exemplo%20dba.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/DBA/exemplo dba.xls|dados]]
- == Esquema Fatorial ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Fatorial/Fatorial.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Fatorial/fatorial2x3.txt|dados]]
- == Parcelas Sub-divididas ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/SubDividida/Subdividida.R|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/SubDividida/subdividida.txt|dados]]
- == Regressão ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Regressao/Regre.r|Script]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Regressao/Escoamento.txt|dados]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Regressao.pdf|Apresentação]]
- == Script geral do curso ==
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Material%20SNW/Script.pdf| pdf]]
-    * [[http://www.leg.ufpr.br/~eder/CursoRFito/Script.R|Script]]

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