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pessoais:walmes:cursorcnpaf [2011/09/27 14:14] walmes [Descrição] |
pessoais:walmes:cursorcnpaf [2011/11/12 20:49] walmes [Estatística Experimental Aplicada] |
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{{ :pessoais:walmes:poder.gif |}} | {{ :pessoais:walmes:poder.gif |}} | ||
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==== Descrição ==== | ==== Descrição ==== | ||
- | Curso ministrado pelo Professor M.Sc. [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:walmes|Walmes Marques Zeviani]] aos Pesquisadores da [[http://www.cnpaf.embrapa.br/|Embrapa Arroz e Feijão]]. O Curso tem o objetivo de apresentar o programa R e sua aplicação na análise de dados de experimentos agronômicos. O Curso será ministrado na [[http://maps.google.com.br/maps?q=embrapa&ie=UTF8&ll=-16.505842,-49.283466&spn=0.02872,0.052314&sll=-16.491604,-49.30943&sspn=0.028723,0.052314&near=GO-462+-+Goi%C3%A2nia+-+GO&geocode=CTZ-7n0hYDR9Ff8sBP8dP4QQ_SmPeAR3zY1ekzEVa6NKEMW19w&vpsrc=6&t=h&z=15&iwloc=A|sede]] Embrapa Arroz e Feijão no período de 21 à 25 de novembro de 2011, das 08:00 às 12:00 e 13:00 às 17horas. | + | Curso ministrado pelo Professor M.Sc. [[http://www.leg.ufpr.br/doku.php/pessoais:walmes|Walmes Marques Zeviani]] aos Pesquisadores da [[http://www.cnpaf.embrapa.br/|Embrapa Arroz e Feijão]]. O Curso tem o objetivo de apresentar o programa R e sua aplicação na análise de dados de experimentos agronômicos. O Curso será ministrado na [[http://maps.google.com.br/maps?q=embrapa&ie=UTF8&ll=-16.505842,-49.283466&spn=0.02872,0.052314&sll=-16.491604,-49.30943&sspn=0.028723,0.052314&near=GO-462+-+Goi%C3%A2nia+-+GO&geocode=CTZ-7n0hYDR9Ff8sBP8dP4QQ_SmPeAR3zY1ekzEVa6NKEMW19w&vpsrc=6&t=h&z=15&iwloc=A|sede]] Embrapa Arroz e Feijão no período de 07 à 11 de novembro de 2011, das 08:00 às 12:00 e 13:00 às 17horas. |
- | <googlemap width="500px" height="500px" lat="-16.502406" lon="-49.281367" type="hybrid" zoom="16"> | + | <googlemap width="1000px" height="400px" lat="-16.502406" lon="-49.281367" type="hybrid" zoom="16"> |
</googlemap> | </googlemap> | ||
- | {{url>http://www.cnpaf.embrapa.br/}} | + | {{url>http://www.cnpaf.embrapa.br/ 1000px, 400px left}} |
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==== Materiais do curso ==== | ==== Materiais do curso ==== | ||
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+ | * Diretório com todos os {{http://www.leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/cnpaf/|arquivos do Curso}}; | ||
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* Arquivo de mensagens da [R-br] hospedada pelo {{http://r-br.2285057.n4.nabble.com/|Nabble}}; | * Arquivo de mensagens da [R-br] hospedada pelo {{http://r-br.2285057.n4.nabble.com/|Nabble}}; | ||
* Página de R por {{http://zoonek2.free.fr/UNIX/48_R/all.html|Vincent Zoonekynd}} (muuuita coisa!); | * Página de R por {{http://zoonek2.free.fr/UNIX/48_R/all.html|Vincent Zoonekynd}} (muuuita coisa!); | ||
+ | * Página de tutoriais em R para estatística, {{http://www.r-tutor.com/|R tutorial}}; | ||
* {{http://www.r-bloggers.com/|R-bloggers}}, o blog dos blogs de R; | * {{http://www.r-bloggers.com/|R-bloggers}}, o blog dos blogs de R; | ||
* {{http://r-project.markmail.org/search/?q=|MarkMail}}, maior gerenciador de listas de discussão sobre R; | * {{http://r-project.markmail.org/search/?q=|MarkMail}}, maior gerenciador de listas de discussão sobre R; | ||
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^ Data ^ Conteúdo ^ | ^ Data ^ Conteúdo ^ | ||
- | | SEG 21 | | | + | | SEG 07 | Introdução sobre o R, páginas de download e IDEs. Objetos, importação, análise gráfica exploratória, estatística descritiva básica, testes de hipótese e intervalos de confiança, ajuste de modelos de regressão linear. | |
- | | TER 22 | | | + | | TER 08 | Medidas de influência em regressão linear múltipla, predição, considerações sobre o R², testes de hipótes e contrastes em modelos de regressão. Modelos de regressão não linear, modelos aplicados às ciências agrárias, considerações sobre estimação e obtenção de valores iniciais, ajuste de uma ou mais curvas, teste de hipótese sobre igualdade de parâmetros. | |
- | | QUA 23 | | | + | | QUA 09 | | |
- | | QUI 24 | | | + | | QUI 10 | | |
- | | SEX 25 | | | + | | SEX 11 | | |
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==== Questionário de avaliação do Curso ==== | ==== Questionário de avaliação do Curso ==== | ||
- | /* | ||
- | Clique para responder o **[[https://spreadsheets.google.com/embeddedform?formkey=dFFPajZIODFFMkE1b0lRNmFvS05iTUE6MA|questionário sobre avaliação do Curso]]**. Não é necessário identificação. O questionário serve para aperfeiçoamento do Curso, portanto, resposta às questões com total sinceridade. Certo de sua colaboração, agradeço. | ||
- | */ | + | Clique para responder o **[[https://docs.google.com/spreadsheet/viewform?hl=pt_BR&formkey=dC1UUldWVWZ0QTRLcldhT0hTMm9BNUE6MA#gid=0|questionário sobre avaliação do Curso]]**. Não é necessário identificação. O questionário serve para aperfeiçoamento do Curso, portanto, resposta às questões com total sinceridade. Certo de sua colaboração, agradeço. |
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==== Pacotes necessários a serem instalados ==== | ==== Pacotes necessários a serem instalados ==== | ||
<code R> | <code R> | ||
# instala os pacotes oficiais usados durante curso via web | # instala os pacotes oficiais usados durante curso via web | ||
- | install.packages(c("fBasics","agricolae","ScottKnott","contrast","multcomp","gplots"), | + | install.packages(c('agricolae', 'aod', 'car', 'contrast', 'DTK', 'ellipse', 'fBasics', |
- | dep=TRUE, repos="http://cran-r.c3sl.ufpr.br/") | + | 'fmsb', 'GAD', 'geoR', 'gmodels', 'gplots', 'HH', 'laercio', 'lattice', |
+ | 'latticeExtra', 'lme4', 'MASS', 'multcomp', 'mutoss', | ||
+ | 'nlme', 'nls2', 'nlstools', 'plotrix', 'plyr', 'reshape', 'rpanel', | ||
+ | 'ScottKnott', 'gWidgetsRGtk2'), dep=TRUE, repos='http://cran-r.c3sl.ufpr.br/') | ||
# link para a página de download do pacote ExpDes | # link para a página de download do pacote ExpDes | ||
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+ | |||
+ | ==== Download de arquivos pelo R no Linux ==== | ||
+ | |||
+ | <code R> | ||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | # diretório web onde estão os arquivos | ||
+ | dire <- "http://www.leg.ufpr.br/~walmes/ensino/ce223-2011-01/" | ||
+ | |||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | # lendo a tabela com nome dos arquivos (via ctrol+c) | ||
+ | tab <- read.table("clipboard", header=FALSE, sep="\t", stringsAsFactors=FALSE) | ||
+ | str(tab) | ||
+ | |||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | # segunda coluna corresponde ao nome dos arquivos | ||
+ | arq <- tab$V2 | ||
+ | |||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | # suponha que eu queira apenas os arquivos de extensão *.R, eles são | ||
+ | extR <- grep(".R$", arq, value=TRUE) | ||
+ | |||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | # formar o nome dos links para download, colocar o wget antes pois é o comando | ||
+ | links <- paste("wget ", dire, extR, sep="") | ||
+ | links[1] | ||
+ | |||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | # usar a função system() para fazer download com wget | ||
+ | |||
+ | sapply(links, system) | ||
+ | |||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | # pronto, todos os downloads foram feitos. Agora você pode ir na página desses | ||
+ | # caras sabidões e ter as notas de aulas, arquivos, seminários para poder | ||
+ | # aprender. Visite essas páginas: | ||
+ | # http://www.commanster.eu/ | ||
+ | # http://socserv.mcmaster.ca/jfox/ | ||
+ | # http://www.stat.wisc.edu/~bates/ | ||
+ | # http://www.stat.missouri.edu/~ferreiram/ | ||
+ | # http://www.isid.ac.in/~deepayan/ | ||
+ | # http://www.math.mcmaster.ca/~bolker/ | ||
+ | #----------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | </code> | ||
==== Procedimento para o ajuste de diversos modelos lineares ==== | ==== Procedimento para o ajuste de diversos modelos lineares ==== | ||
Linha 396: | Linha 445: | ||
* revisar a análise dos dados ''volume.txt'', aplicar uma transformação para corrigir a heterogeneidade de variâncias. | * revisar a análise dos dados ''volume.txt'', aplicar uma transformação para corrigir a heterogeneidade de variâncias. | ||
* fazer uma enquete para avaliar a qualidade do curso. | * fazer uma enquete para avaliar a qualidade do curso. | ||
+ | * análise em blocos aumentados de Federer; | ||
+ | * análise em alpha-lattice; | ||
</note> | </note> | ||