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pessoais:walmes:cursorcpao [2012/06/26 19:30]
walmes
pessoais:walmes:cursorcpao [2012/06/26 20:00]
walmes [Cronograma de atividades do Curso]
Linha 13: Linha 13:
 ---- ----
  
-==== Ementa da disciplina ==== 
  
-Introdução a linguagem e interface de trabalho; Importação de dados; Análise exploratória de dados; Testes de significâncias;​ Análise de regressão linear e não linear; Análise de dados em delineamentos experimentais;​ Análise de experimentos com respostas do tipo proporção e contagem. 
- 
----- 
  
 ==== Justificativa ==== ==== Justificativa ====
Linha 44: Linha 40:
  
  
 +----
 +
 +==== Links úteis ====
 +
 +  * {{http://​cran.r-project.org/​|CRAN}},​ o site do R: {{http://​cran.r-project.org/​bin/​windows/​base/​|download}},​ {{http://​cran.r-project.org/​manuals.html|manuais do R}} e {{http://​cran.r-project.org/​other-docs.html|tutoriais em geral}};
 +  * Página de {{http://​www.rstudio.org/​download/​desktop|download do RStudio}}, a interface mais amigável do R;
 +  * Material do Curso do Professor {{http://​www.leg.ufpr.br/​doku.php/​sofware:​material-r|Paulo Justiniano Ribeiro Júnior}} (UFPR);
 +  * Material do Cursos do Professor {{http://​www.dex.ufla.br/​~danielff/​index.htm|Daniel Furtado Ferreira}} (UFLA);
 +  * Dicas curtas sobre R, as {{http://​www.leg.ufpr.br/​doku.php/​ridiculas|Rídiculas do LEG}};
 +  * Página de descrição da {{http://​www.leg.ufpr.br/​doku.php/​software:​rbr|[R-br]}},​ a lista Brasileira oficial de usuários do R;
 +  * Arquivo de mensagens da [R-br] hospedada pelo {{http://​r-br.2285057.n4.nabble.com/​|Nabble}};​
 +  * Página de R por {{http://​zoonek2.free.fr/​UNIX/​48_R/​all.html|Vincent Zoonekynd}} (muuuita coisa!);
 +  * Página de tutoriais em R para estatística,​ {{http://​www.r-tutor.com/​|R tutorial}};
 +  * {{http://​www.r-bloggers.com/​|R-bloggers}},​ o blog dos blogs de R;
 +  * {{http://​r-project.markmail.org/​search/?​q=|MarkMail}},​ maior gerenciador de listas de discussão sobre R;
 +  * {{http://​www.statmethods.net/​index.html|Quick-R}},​ blog de como fazer coisas com o R;
 +  * {{http://​www.ats.ucla.edu/​stat/​|UCLA}} e {{http://​www.ats.ucla.edu/​stat/​dae/​|tutoriais}} sobre análise de dados com o R;
 +  * {{http://​animation.yihui.name/​|Aniwiki}},​ animações didáticas com o R;
 +  * {{http://​vgoulet.act.ulaval.ca/​en/​emacs/​|Emacs}} para Windows;
 +  * {{http://​rtricks.wordpress.com/​|R-tricks}},​ dicas e malandragens com o R;
 +  * {{http://​egret.psychol.cam.ac.uk/​statistics/​R/​graphs1.html|Gráficos básicos}} com o R;
 +  * {{http://​sites.google.com/​site/​marcosfs2006/​material_r|Materiais}} em português sobre R;
 +  * {{http://​addictedtor.free.fr/​graphiques/​|R gallery}}, a galeria de gráficos requintados do R;
 +  * Página {{http://​rwiki.sciviews.org/​doku.php|WIKI}} do R;
 +  * {{http://​www2.ekol.slu.se/​wiki/​index.php/​Learn_R|Learn R}} da página do Departamento de Ecologia da Wright State University.
 +  * O básico de {{http://​liutaiomottola.com/​myth/​expdesig.html|delineamento}} experimental;​
 +  * {{http://​www.r-tutor.com/​|R-tutor}},​ tutoriais sobre R;
 +  * {{http://​cran.r-project.org/​doc/​contrib/​Vikneswaran-ED_companion.pdf|Compendio}} R de delineamento experimental;​
 +  * {{http://​www.utdallas.edu/​~herve/​R_comp4Abdi_ExperimentalDesign.pdf|Compendio}} R para análise de delineamento experimental em psicologia;
 +  * Manual R de {{http://​www.biostat.uni-hannover.de/​fileadmin/​institut/​pdf/​RMANUAL_ENGLISH.PDF|biometria}},​ por Katharina Hoff;
 +  * Material do {{http://​cran.r-project.org/​doc/​contrib/​Faraway-PRA.pdf|John Faraway}}, Anova e regressão com o R;
 +  * Tutorial do {{http://​www.rensenieuwenhuis.nl/​documents/​Applied%20R.pdf|Rense Nieuwenhuis}},​ R aplicado para o cientista social quantitativo;​
 +  * Manual R que acompanha o livro Categorical Data Analysis, por {{https://​home.comcast.net/​~lthompson221/​Splusdiscrete2.pdf|Laura Thompson}}.
 +  * Página do Professor {{https://​sites.google.com/​site/​ericbferreira/​unifal/​downloads-1|Eric Batista Ferreira}} desenvolvedor do pacote não oficial **ExpDes**;
 +  * Apostila de Estatística Experimental da Pesquisadora {{http://​www.cnpab.embrapa.br/​publicacoes/​download/​doc163.pdf|Janaína Ribeiro Costa}} (Embrapa);
 +  * Cartilha de referência do R por {{http://​cran.r-project.org/​doc/​contrib/​Short-refcard.pdf|Tom Short}}, traz um resumo das funções mais usadas;
 +  * Lista das abreviações dos pacotes e funções do R por {{http://​jeromyanglim.blogspot.com/​2010/​05/​abbreviations-of-r-commands-explained.html|Jeromy Anglim}};
 +  * Página da disciplina de {{http://​www.leg.ufpr.br/​ce223|Estatística Computacional}} que ensina o R como aplicativo estatístico e ferramenta computacional. Os scripts usados em aula estão disponíveis e são arquivos reproduzíveis.
 +
 +----
 +  ​
 +==== Cronograma de atividades do Curso ====
 +
 +^  Data   ^ Conteúdo ^
 +|  SEG 25 | Download, instalação,​ interfaces gráficas e documentação. Primeira sessão R, componentes da sessão, componentes do RStudio. Criação de objetos, seleção, importação de arquivos de texto. Análise de experimento em DIC e avaliação dos pressupostos. | 
 +|  TER 26 | Análise de experimento em DBC com repetição desigual dentro das parcelas, uso de pesos na análise de variância. Análise de experimento fatorial usando o inverso da variância como pesos. Análise de experimento fatorial com fatores quantitativos. Ajuste de modelo de regressão não linear resposta-platô. |
 +|  QUA 27 |  | 
 +|  QUI 28 |  | 
 +|  SEX 29 |  |
 +
 +----
 +
 +==== Referências bibliográficas ====
 +<​bibtex>​
 +
 +@TechReport{ribeiro_jr-leg,​
 + url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~paulojus/​embrapa/​Rembrapa/​Rembrapa.pdf},​
 + year = {2009},
 + author = {Paulo Justiniano {Ribeiro Júnior}},
 + title = {Introdução ao Ambiente Estatístico R}
 +}
 +
 +@TechReport{faraway-cran,​
 + url = {http://​cran.r-project.org/​doc/​contrib/​Faraway-PRA.pdf},​
 + year = {2002},
 + author = {Julian J. Faraway},
 + title = {Practical Regression and Anova using {R}}
 +}
 +
 +@book{faraway_linear_2005,​
 +        title = {Linear models with R},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Linear%20Models%20with%20R.pdf},​
 + isbn = {9781584884255},​
 + publisher = {Chapman \& Hall/​{CRC}},​
 + author = {Julian James Faraway},
 + year = {2005},
 + pages = {244}
 +}
 +
 +@book{venables_modern_2002,​
 + title = {Modern applied statistics with S},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Modern%20Applied%20Statistical%20Methods%20with%20S%20plus.pdf},​
 + isbn = {9780387954578},​
 + publisher = {Birkhäuser},​
 + author = {William N. Venables and Brian D. Ripley},
 + year = {2002},
 + pages = {518}
 +}
 +
 +
 +@book{everitt_handbook_2009,​
 + edition = {2},
 + title = {A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition},
 +        %url = {http://​www.maths.bath.ac.uk/​~jjf23/​ELM/​},​
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​A%20handbook%20of%20statistical%20analyses%20using%20R.pdf},​
 + isbn = {1420079336},​
 + publisher = {Chapman \& Hall},
 + author = {Brian S. Everitt and Torsten Hothorn},
 + month = jul,
 + year = {2009}
 +}
 +
 +@book{dalgaard_introductory_2008,​
 + edition = {2nd},
 + title = {Introductory Statistics with R},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Introductory%20Statistics%20with%20R.pdf},​
 + isbn = {0387790535},​
 + publisher = {Springer},
 + author = {Peter Dalgaard},
 + month = aug,
 + year = {2008}
 +}
 +
 +@book{dobson_introduction_2008,​
 + edition = {3},
 + title = {An Introduction to Generalized Linear Models, Third Edition},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​An%20introduction%20to%20generalized%20linear%20models.pdf},​
 + isbn = {1584889500},​
 + publisher = {Chapman and {Hall/​CRC}},​
 + author = {Annette J. Dobson and Adrian Barnett},
 + month = may,
 + year = {2008}
 +}
 +
 +@book{ritz_nonlinear_2008,​
 + edition = {1},
 + title = {Nonlinear Regression with R},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Nonlinear%20Regression%20with%20R.pdf},​
 + isbn = {0387096159},​
 + publisher = {Springer},
 + author = {Christian Ritz and Jens Carl Streibig},
 + month = nov,
 + year = {2008}
 +}
 +
 +@book{sarkar_lattice:​_2008,​
 + edition = {1},
 + title = {Lattice: Multivariate Data Visualization with R},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Lattice%20Multivariate%20Data%20Visualization%20with%20R.pdf},​
 + isbn = {0387759689},​
 + shorttitle = {Lattice},
 + publisher = {Springer},
 + author = {Deepayan Sarkar},
 + month = mar,
 + year = {2008}
 +}
 +
 +@book{murrell_r_2005,​
 + edition = {1},
 + title = {R Graphics},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​R%20Graphics.pdf},​
 + isbn = {{158488486X}},​
 + publisher = {Chapman and {Hall/​CRC}},​
 + author = {Paul Murrell},
 + month = jul,
 + year = {2005}
 +}
 +
 +@book{maindonald_data_2010,​
 + edition = {3},
 + title = {Data Analysis and Graphics Using R: An Example-Based Approach},
 + isbn = {0521762936},​
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Data%20Analysis%20and%20Graphics%20Using%20R%203rd.pdf},​
 + shorttitle = {Data Analysis and Graphics Using R},
 + publisher = {Cambridge University Press},
 + author = {John Maindonald and W. John Braun},
 + month = jun,
 + year = {2010}
 +}
 +
 +@book{pinheiro_mixed-effects_2009,​
 + edition = {1st ed. 2000. 2nd printing},
 + title = {Mixed-Effects Models in S and {S-PLUS}},
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Mixed%20Effects%20Models%20in%20S%20and%20S-Plus.pdf},​
 + isbn = {1441903178},​
 + publisher = {Springer},
 + author = {Jos\'​{e} Pinheiro and Douglas Bates},
 + month = apr,
 + year = {2009}
 +}
 +
 +@book{cox_theory_2000,​
 + edition = {1},
 + title = {The Theory of the Design of Experiments},​
 +        url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​The%20theory%20of%20the%20design%20of%20experiments.pdf},​
 + isbn = {{158488195X}},​
 + publisher = {Chapman and {Hall/​CRC}},​
 + author = {{D.R.} Cox and Nancy Reid},
 + month = jun,
 + year = {2000}
 +}
 +
 +@TechReport{beasley:​04,​
 + url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Beasley-BioestatisticaUsandoR.pdf},​
 + year = {2004},
 + author = {Colin Robert Beasley},
 + title = {Bioestatística usando o R - apostila de exemplos para o biólogo}
 +}
 +
 +@TechReport{correa-gonzales:​2002,​
 + url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Gr%c3%a1ficos%20Estat%c3%adsticos%20no%20R.pdf},​
 + year = {2002},
 + author = {Juan Carlos Correa and Nelfi González},
 + title = {Gráficos Estadísticos con R}
 +}
 +
 +@TechReport{maia-etal:​05,​
 + url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​Software%20Livre%20R%20-%20aplica%c3%a7%c3%a3o%20estat%c3%adstica%20(vi%c3%a7osa).pdf},​
 + year = {2005},
 + author = {Emanuel Fernando Maia de Souza and Luiz Alexandre Peternelli and Márcio Pupin de Mello},
 + title = {Software Livre R: aplicação estatística}
 +}
 +
 +@TechReport{monteiro:​06,​
 + url = {http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​docs/​biometria.pdf},​
 + year = {2006},
 + author = {Leandro R Monteiro},
 + title = {Introdução à biometria usando o R}
 +}
 +
 +
 +</​bibtex>​
 +
 +----
 +
 +==== Questionário de avaliação do Curso ====
 +
 +Clique para responder o **[[https://​docs.google.com/​spreadsheet/​viewform?​hl=pt_BR&​formkey=dC1UUldWVWZ0QTRLcldhT0hTMm9BNUE6MA#​gid=0|questionário sobre avaliação do Curso]]**. Não é necessário identificação. O questionário serve para aperfeiçoamento do Curso, portanto, resposta às questões com total sinceridade. Certo de sua colaboração,​ agradeço.
 +
 +----
 +
 +
 +==== Pacotes necessários a serem instalados ====
 +
 +<code R>
 +# instala os pacotes oficiais usados durante curso via web
 +install.packages(c('​agricolae',​ '​aod',​ '​car',​ '​contrast',​ '​DTK',​ '​ellipse',​ '​fBasics',​
 +                   '​fmsb',​ '​GAD',​ '​geoR',​ '​gmodels',​ '​gplots',​ '​HH',​ '​laercio',​ '​lattice',​
 +                   '​latticeExtra',​ '​lme4',​ '​MASS',​ '​multcomp',​ '​mutoss',​
 +                   '​nlme',​ '​nls2',​ '​nlstools',​ '​plotrix',​ '​plyr',​ '​reshape',​ '​rpanel',​
 +                   '​ScottKnott',​ '​gWidgetsRGtk2'​),​ dep=TRUE, repos='​http://​cran-r.c3sl.ufpr.br/'​)
 +
 +# link para a página de download do pacote ExpDes
 +browseURL(URLencode("​https://​sites.google.com/​site/​ericbferreira/​unifal/​downloads-1"​))
 +</​code>​
 +
 +----
 +
 +==== Espaço do participante (feedback) ====
 +
 +Dê sua opinião e me ajude a melhorar o curso. Critique, comente, sugira, tire dúvidas, peça a inclusão de novos procedimentos,​ discuta, expresse-se. Sua opinião é muito importante.
 +
 +{{threads>​pessoais:​walmes:​cursorufgd:​discussion}}
 +
 +~~DISCUSSION~
 +~
  
-PÁGINA EM CONSTRUÇÃO 
  
 Abordar os modelos loess, gam. Usar o livro do Faraway - Extending. Abordar os modelos loess, gam. Usar o livro do Faraway - Extending.
 [[http://​www.gardenersown.co.uk/​Education/​Lectures/​R/​nonparam.htm|Using R for statistical analyses - Non-parametric stats]] [[http://​www.gardenersown.co.uk/​Education/​Lectures/​R/​nonparam.htm|Using R for statistical analyses - Non-parametric stats]]

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