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pessoais:walmes:cursorcpao [2012/06/26 19:41]
walmes
pessoais:walmes:cursorcpao [2012/06/29 17:01]
walmes
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 ====== Curso em análise de experimentos com afastamento das pressuposições ====== ====== Curso em análise de experimentos com afastamento das pressuposições ======
 +
 +{{:​pessoais:​walmes:​dsc05114_2_.jpg?​nolink&​800|}}
 +
 +----
  
 ==== Descrição ==== ==== Descrição ====
  
-Curso ministrado pelo Professor M.Sc. [[http://​www.leg.ufpr.br/​doku.php/​pessoais:​walmes|Walmes Marques Zeviani]] aos Pesquisadores da [[http://​www.cpao.embrapa.br/​|Embrapa Agropecuária Oeste]]. O Curso tem o objetivo de apresentar o programa R e sua aplicação na análise de dados de experimentos agronômicos dando enfase no tratamento de experimentos não regulares, ou seja, aqueles que apresentam desvios de pressupostos do modelo de análise de variância/​regressão. O Curso será ministrado na [[https://​maps.google.com.br/​maps?​daddr=-22%C2%B0+16'​+27.35%22,​+-54%C2%B0+49'​+0.71%22+(-22.274264,​+-54.816864)&​hl=pt-BR&​ie=UTF8&​ll=-22.274443,​-54.81755&​spn=0.011715,​0.01929&​sll=-22.274423,​-54.816928&​sspn=0.011715,​0.01929&​geocode=CWgapj0foQQVFSgfrP4doI-7_A&​t=h&​mra=mift&​z=16|sede]] Embrapa ​Arroz e Feijão ​no período de 25 à 29 de junho de 2012, das 08:00 às 11:00 e 13:00 às 16 horas, perfazendo um total de 30 horas de Curso.+Curso ministrado pelo Professor M.Sc. [[http://​www.leg.ufpr.br/​doku.php/​pessoais:​walmes|Walmes Marques Zeviani]] aos Pesquisadores da [[http://​www.cpao.embrapa.br/​|Embrapa Agropecuária Oeste]]. O Curso tem o objetivo de apresentar o programa R e sua aplicação na análise de dados de experimentos agronômicos dando enfase no tratamento de experimentos não regulares, ou seja, aqueles que apresentam desvios de pressupostos do modelo de análise de variância/​regressão. O Curso será ministrado na [[https://​maps.google.com.br/​maps?​daddr=-22%C2%B0+16'​+27.35%22,​+-54%C2%B0+49'​+0.71%22+(-22.274264,​+-54.816864)&​hl=pt-BR&​ie=UTF8&​ll=-22.274443,​-54.81755&​spn=0.011715,​0.01929&​sll=-22.274423,​-54.816928&​sspn=0.011715,​0.01929&​geocode=CWgapj0foQQVFSgfrP4doI-7_A&​t=h&​mra=mift&​z=16|sede]] Embrapa ​Agropecuária Oeste no período de 25 à 29 de junho de 2012, das 08:00 às 11:00 e 13:00 às 16 horas, perfazendo um total de 30 horas de Curso.
  
 <​googlemap width="​1000px"​ height="​400px"​ lat="​-22.274264"​ lon="​-54.816864"​ type="​hybrid"​ zoom="​16">​ <​googlemap width="​1000px"​ height="​400px"​ lat="​-22.274264"​ lon="​-54.816864"​ type="​hybrid"​ zoom="​16">​
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 ==== Conteúdo ==== ==== Conteúdo ====
  
-    ​Revisão sobre download, instalação do programa ​da interface gráfica; +  ​Nivelamento ​revisão com relação aos modelos estatísticos para os experimentos mais comunsos pressupostos envolvidos ​formas ​de verificar os pressupostos. 
-    * Revisão sobre manipulação de objetos e funções no R: definição de objetotipos de objeto, criação, acesso ​modificação ​de objetos, criação e aplicação de funções; +  O método da máxima verossimilhançafunção ​de verossimilhançaestimaçãointervalos ​de confiançaregiões ​de confiança, teste de hipótese. 
-    Importação de dados e análise exploratóriaentrada ​de dados por arquivo externoanálise gráfica exploratória;​ +  Modelos lineares generalizadosdistribuições pertencentes, pressuposições,​ estimação,​ teste de hipótese, predição, ​estudo ​de caso
-    * Estatística básica: estatísticas descritivas de posiçãodispersão, assimetria, curtose, gráficos ​de distribuição de frequênciateste de normalidade,​ teste de aderência, geração de números aleatórios, teste de hipótese ​e intervalos de confiança para médias, proporções,​ variâncias e correlações+  Modelos de análise de sobrevivênciadistribuições envolvidaspressuposições, estimação,​ teste de hipótese, ​prediçãoestudos ​de caso; 
-    Regressão linearpreparação dos dadosdefinição do modelo e pressuposições,​ estimação ​dos parâmetrosinterpretação dos parâmetros,​ análise de resíduos e checagem das pressuposições do modelo, medidas de influência,​ inferência para os parâmetros (teste de hipótese, intervalos de confiança, regiões de confiança), predição ​de valoreselaboração ​de gráficos, procedimento stepwise, critério de AIC e BIC, remoção de outliers, transformação de dados+  * Transformações nas variáveis para atender a normalidade e/ou homocedasticidade em modelos ​gaussianos;​ 
-    Regressão não lineardefiniçãoexemplos, preparação dos dados, definição do modelo, estimação ​dos parâmetrosanálise de resíduos, inferência para os parâmetros (teste de hipótese, ​intervalos de confiançateste da razão de verossimilhança),​ comparação de curvas ajustadas, ajuste ​de modelos com restrição na estimação ​dos parâmetrospredição ​de valoreselaboração ​de gráficos+  * Modelos lineares gaussianos ​com modelagem da variância: ​estimação, ​teste de hipótese, prediçãoestudos ​de caso
-    Análise de experimentos balanceados:​ experimento em delineamento inteiramente casualizado ​com fator qualitativo ​(um fator e fatorial duplo)experimento em blocos casualizados com fator qualitativo (um fator e fatorial duplo), experimento fatorial duplo com tratamentos adicionais (testemunhas),​ análise ​de covariânciamodelos ​de regressão polinomial na análise de variância (fatorial qualitativo x quantitativo),​ fatorial ​com fatores quantitativos (modelos ​de superfície de resposta), experimento em parcela subdividida ​subsubdividida,​ faixa e medida repetida no tempo, análise ​de resíduos, checagem das pressuposições do modelo, transformação ​de dados, testes de médias e contrastes, +  Modelos lineares gaussianos ​com modelagem correlação ​(estudos longitudinaismedidas repetidas): estimaçãoteste de hipótesepredição, estudos ​de caso; 
-    Análise de experimentos ​não balanceados/​ortogonaisexperimento com um fator em delineamento inteiramente casualizado e blocos casualizadosanova e teste de médiasanálise ​de experimento em blocos incompletosalfa-láticesanálise ​de experimentos com fator de efeito aleatórioinclusão ​de co-variáveis nos modelos, +  * Modelos lineares gaussianos ​com termos ​de efeito aleatório ​estimação ​de componentes ​de variância; 
-    Introdução a análise de experimentos ​com respostas não normais: definição de modelo linear generalizado,​ estimação de parâmetros,​ métodos de inferência,​ análise respostas do tipo proporção,​ análise de respostas do tipo contagem;+  Modelos ​não linearesestimaçãointervalos ​de confiançateste de hipóteseprediçãocomparação ​de parâmetros e/ou curvas ​de regressãoestudos ​de caso; 
 +  Tópicos em análise ​não paramétrica ​de experimentos.
  
 ---- ----
- 
 ==== Materiais do curso ==== ==== Materiais do curso ====
  
-  * Diretório com todos os {{http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​cursoR/​cnpaf/|arquivos do Curso}};+  * Diretório com todos os {{http://​www.leg.ufpr.br/​~walmes/​cursoR/​cpao/|arquivos do Curso}}; 
 +  * Apresentação Prezi {{http://​prezi.com/​nldtrhcqyaql/​estatistica-experimental/​}};​ 
 +  * Experimental Designs for Research in Education {{http://​prezi.com/​-nfyorqf2gyw/​experimental-designs-for-research-in-education/​}};
  
 +<code R>
 +#​------------------------------------------------------------------------------------------
 +# análise de dados binomial
  
-----+trat <gl(3, 8) 
 +X <model.matrix(~trat) 
 +pars <c(2,1,1) 
 +nu <X%*%pars 
 +p <- exp(nu)/​(1+exp(nu)) 
 +y <- rbinom(length(p),​ size=10, prob=p)
  
 +dados <- data.frame(trat=trat,​ y=y)
 +
 +g0 <- glm(cbind(y,​ 10-y)~trat, data=trat, family=binomial)
 +summary(g0) # se Residual Deviance/​graus de liberade próximo de 1, use test="​Chisq"​
 +anova(g0, test="​Chisq"​)
 +
 +#​------------------------------------------------------------------------------------------
 +# como fazer testes de "​médias"​
 +
 +require(doBy)
 +popMeans(g0,​ effect="​trat"​) # estimativas dos parâmetros do preditor
 +
 +require(glht)
 +summary(glht(g0,​ linfct=mcp(trat="​Tukey"​))) # diferença nas estimativas
 +
 +#​------------------------------------------------------------------------------------------
 +# experimento em bloco
 +
 +dados <- expand.grid(bloco=gl(3,​1),​ trat=gl(5,​1))
 +X <- model.matrix(~bloco+trat,​ dados)
 +pars <- c(1, 1.1,1.2, -1,​-0.5,​0.5,​0.3)
 +nu <- X%*%pars
 +
 +p <- exp(nu)/​(1+exp(nu))
 +dados$y <- rbinom(nrow(dados),​ size=50, prob=p)
 +
 +g0 <- glm(cbind(y,​ 50-y)~bloco+trat,​ data=dados, family=binomial)
 +summary(g0)
 +
 +popMeans(g0,​ effect="​trat"​)
 +
 +summary(glht(g0,​ linfct=mcp(trat="​Tukey"​)))
 +
 +#​------------------------------------------------------------------------------------------
 +</​code>​
 +
 +
 +----
 ==== Links úteis ==== ==== Links úteis ====
  
Linha 84: Linha 136:
  
 ^  Data   ^ Conteúdo ^ ^  Data   ^ Conteúdo ^
-|  SEG 25 | Download, instalação,​ interfaces gráficas e documentação. ​|  +|  SEG 25 | Download, instalação,​ interfaces gráficas e documentação. ​Primeira sessão Rcomponentes da sessãocomponentes do RStudioCriação ​de objetosseleçãoimportação ​de arquivos ​de texto. Análise de experimento ​em DIC avaliação dos pressupostos. |  
-|  TER 08 | Medidas de influência em regressão linear múltiplaprediçãoconsiderações sobre o R², testes de hipóteses e contrastes em modelos de regressãoModelos ​de regressão não linearmodelos aplicados às ciências agrárias, considerações sobre estimação e obtenção de valores iniciais, ajuste de uma ou mais curvasteste de hipótese sobre igualdade ​de parâmetros+|  ​TER 26 | Análise de experimento ​em DBC com repetição desigual dentro das parcelasuso de pesos na análise de variância. Análise de experimento fatorial usando o inverso da variância como pesos. Análise de experimento ​fatorial com fatores ​quantitativos. Ajuste ​de modelo ​de regressão não linear resposta-platô
-|  QUA 09 | Análise de experimentos em delineamento inteiramente casualizado,​ experimentos ​em blocos completos casualizados ​blocos incompletos. |  +|  QUA 27 |  |  
-|  ​QUI 10 | Análise de experimento ​fatorial duplo com fatores categóricosanálise ​de covariância, ​análise de fatorial com fatores ​contínuos, modelagem da heterogeneidade ​de variâncias,​ uso de pesos no ajuste. |  +|  QUI 28 |  ​|  
-|  SEX 11 Análise de experimento fatorial com ajuste de polinômios,​ análise de experimentos em parcela subdivida, subsubdividida e dados longitudinais,​ análise conjunta de experimentos,​ análise de dados de proporção (glm binomial). ​|+|  SEX 29  |
  
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 ==== Questionário de avaliação do Curso ==== ==== Questionário de avaliação do Curso ====
  
-Clique para responder o **[[https://​docs.google.com/​spreadsheet/​viewform?​hl=pt_BR&​formkey=dC1UUldWVWZ0QTRLcldhT0hTMm9BNUE6MA#​gid=0|questionário sobre avaliação do Curso]]**. Não é necessário identificação. O questionário serve para aperfeiçoamento do Curso, portanto, resposta às questões com total sinceridade. Certo de sua colaboração,​ agradeço.+Clique para responder o **[[https://​docs.google.com/​spreadsheet/​viewform?​formkey=dGJFX3VFMEJuQzhicTl1RGhycF9BN3c6MQ|questionário sobre avaliação do Curso]]**. Não é necessário identificação. O questionário serve para aperfeiçoamento do Curso, portanto, resposta às questões com total sinceridade. Certo de sua colaboração,​ agradeço.
  
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- 
  
 ==== Pacotes necessários a serem instalados ==== ==== Pacotes necessários a serem instalados ====
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 <code R> <code R>
 # instala os pacotes oficiais usados durante curso via web # instala os pacotes oficiais usados durante curso via web
-install.packages(c('​agricolae',​ '​aod',​ '​car',​ '​contrast', 'DTK', '​ellipse',​ '​fBasics',​ +install.packages(c('​agricolae',​ '​aod',​ '​car',​ '​contrast',​ '​ellipse',​ '​fBasics',​ 
-                   '​fmsb', '​GAD',​ 'geoR', '​gmodels',​ '​gplots',​ '​HH',​ 'laercio', 'lattice', +                   '​fmsb',​ '​gmodels',​ '​gplots',​ '​HH',​ 'lattice', 'latticeExtra', 
-                   '​latticeExtra', 'lme4', 'MASS', 'multcomp', 'mutoss', +                   '​lme4', 'multcomp', 'nls2', 'nlstools', 'plotrix', 'plyr', 
-                   'nlme', 'nls2', 'nlstools', 'plotrix', 'plyr', 'reshape', 'rpanel', +                   'reshape', 'ScottKnott', 'doBy', 'nlrwr', 'memisc', 'bbmle', 
-                   '​ScottKnott', 'gWidgetsRGtk2'), dep=TRUE, repos='​http://​cran-r.c3sl.ufpr.br/'​+                   '​rootSolve', 'gdata',​ '​psych',​ '​Hmisc',​ '​ExpDes'), dep=TRUE, repos='​http://​cran-r.c3sl.ufpr.br/'​)
- +
-# link para a página de download do pacote ExpDes +
-browseURL(URLencode("​https://​sites.google.com/​site/​ericbferreira/​unifal/​downloads-1"​))+
 </​code>​ </​code>​
  
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 ==== Espaço do participante (feedback) ==== ==== Espaço do participante (feedback) ====
  

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