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pessoais:wbonat:nutri [2009/05/20 10:45]
wbonat
pessoais:wbonat:nutri [2010/02/13 15:20]
wbonat
Linha 1: Linha 1:
-====== Listas ​de exercícios ​=====+===== Aplicações ​de inferência bayesiana aproximada para modelos gaussianos latentes espaço temporais ​=====
-{{:​pessoais:​wbonat:​lista1nutri.pdf|Primeira lista - Intervalo de Confiança}}+
  
-====== Tabelas e Formulários ====== +== Resumo ​==
-{{:​disciplinas:​pdf:​tabeladistribuicaonormal.pdf|Tabela distribuição Normal}}+
  
-{{:​pessoais:​wbonat:​formulario.pdf|Formulário Geral}}+A família dos modelos gaussianos latentes é adaptável a uma grande quantidade de aplicações que requere modelagem complexa. Em particular, dados espaço-temporais estão entre as mais desafiadoras para modelagem estatística. O objetivo deste trabalho foi revisar algumas possíveis estratégias de modelagem para dados deste tipo, incluindo interações espaço-temporal. A inferência nesta classe de modelos é comumente realizada usando métodos computacionalmente intensivos, tais como, os algoritmos MCMC \textit{Markov Chain Monte Carlo}.Entretanto implementações rotineiras de tais algoritmos em problemas espaciais e/ou temporais não estão livres de problemas associados à dimensão e estrutura de dependências. Assim novos métodos e algoritmos para inferência nesta família de modelos têm sido propostos. Este trabalho revisou a abordagem '​INLA'​ '​\textit{Integrated Nested Laplace Approximations}'​ proposta por RUE, MARTINO e CHOPIN (2009),  
 +que se mostrou eficiente para ajustar modelos altamente estruturados em diversas situações práticas 
 +A nova metodologia de inferência foi aplicada a três problemas com diferentes objetivos e estruturas no conjunto de dados. Sempre que possível os modelos ajustados pelo INLA, foram confrontados com ajustes de modelos aditivos generalizados para verificar a concordância entre as abordagens, principalmente no que diz respeito ao modo como captam os efeitos espaciais e temporais. Os conjuntos de dados foram selecionados de modo a cobrir os modelos mais comumente usados na literatura.  
 +O primeiro conjunto refere-se a avaliações da qualidade da água, assumindo normalidade para a variável resposta.  
 +O segundo conjunto tem como resposta a contagens de ovos do mosquito \textit{Aedes aegypticoletados em ovitrampas em Recife/PE,  
 +para a qual assume-se a distribuição binomial negativa.  
 +O terceiro conjunto corresponde a dados sobre a doença leprose-dos-citros,​ assumindo para a distribuição binomial para a variável resposta de presença ou ausência da doença.  
 +Nos três conjuntos de dados analisados foi feita ainda uma comparação entre os resultados obtidos pelas abordagens INLA e GAM (modelos aditivos generalizados).  
 +No primeiro problema os resultados produzidos pelas duas abordagens foram semelhantes. ​
  
 +Para o segundo conjunto algumas diferenças importantes foram encontradas,​ covariáveis que pela abordagem GAM eram indicadas como significativas, ​
  
-====== Equipes ​para a Resenha ​ ====== +pela abordagem INLA foram indicadas como não significativas,​ embora com predições semelhantes ​para os efeitos espaciais e temporais
-===== Recomendações gerais ===== +
- - Comente brevemente a relevância do problema tratado pelo artigo.+
  
- - Avalie a forma de condução da pesquisa. (Coleta ​tratamento dos dados).+O último é mais desafiador exemplo, mostrou uma grande diferença entre as abordagens na forma como captam os efeitos espaciais ​temporais
  
- - Identifique quais as técnicas estatísticas utilizadas pelo autor. (Intervalo ​de ConfiançaTeste de hipóteses,​...etc).+De forma geral a abordagem GAM tende a suavizar demais estes efeitos e fornece intervalos ​de confiança pouco realísticosao passo que a abordagem INLA apresenta melhores resultados e intervalos ​de credibilidade para predições com melhor cobertura
  
- Comente sobre as técnicas e do seu uso para a solução do problema em questão.+Neste caso não foi possível obter estimativas confiáveis de interações espaço-temporais.
  
- - Avalie a forma de emprego das técnicas estatísticas.+Nos três exemplos, medidas ​de concordância entre as observações e os modelos foram tomadas, foram elas: erro quadrático médio, erro absoluto médio, correlação entre observados e preditos e taxa de cobertura
  
- - Comente brevemente sobre os principais resultados ​em que estatística colaborou para estes.+Por estas medidas em todos os exemplos analisados a abordagem INLA se mostrou mais flexiível ​adequada ​apresentou melhores resultados.
  
- - Conclua fazendo críticas, sugestões ou recomendações para a melhoria do artigo em termos de uso da estatística.+====== Códigos dos exemplos ======
  
- - Para fazer download dos arquivos desta página você precisa usar o navegador Mozilla Firefox( Não use o Internet Explorer ​do (R)Windows).+{{:​pessoais:​wbonat:​iqa.r|Qualidade da água de reservatórios operados pela Copel no estado ​do Paraná}}
  
-===== Equipe 1 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​aedes.r|Investigando fatores associados a ocorrência de Aedes aegypti coletados em ovitrampas em Recife/PE}}
-  - Fernanda Uber +
-  - Carolina W. Hartmann +
-  - Juliana Gonçalves +
-  - Lourdes Fedrovicz +
-{{:​pessoais:​wbonat:​04.pdf|Artigo sugerido}}+
  
-===== Equipe 2 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​citrus.rAnálise do padrão espaço-temporal da leprose-dos-citrus}}
-  - Ana Paula +
-  - Ariane +
-  - Francielly +
-  - Laís +
-  - Marina +
-{{:​pessoais:​wbonat:​05.pdf|Artigo sugerido}}+
  
-===== Equipe 3 ===== +====== Funções adicionais ======
-  - Andrieli +
-  - Bruna Larissa +
-  - Camila Náter +
-  - Camila Ono +
-  - Luíza +
-{{:​pessoais:​wbonat:​port.pdf|Artigo sugerido}}+
  
-===== Equipe 4 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​descritiva.rFaz vários boxplots na mesma janela.}}
-  - Caroline Benvenutti +
-  - Fabiane Volaco +
-  - Helena Ferrari +
-  - Marília Zaporolli +
-  - Paola Altheia +
-{{:​pessoais:​wbonat:​v35n1a09.pdf|Artigo sugerido}}+
  
-===== Equipe 5 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​mat.inla.rEscreve a matriz de interação na forma do INLA}}
-  - Flávia Bianconi +
-  - Rafael Charan +
-  - Fernando Henrique Corsico +
-  - Gustavo E. de Godoi +
-  - Paola Altheia +
-{{:​pessoais:​wbonat:​09.pdf|Artigo sugerido}}+
  
-===== Equipe 6 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​restricoes.rConstrói a matriz de restrições}}
-  - Evelyn Opuska +
-  - Francine Aniceto +
-  - Talita Pigato +
-  - Ana Carolina +
-{{:​pessoais:​wbonat:​10.pdf|Artigo sugerido}}+
  
 +{{:​pessoais:​wbonat:​mat.temporal.r| Constrói a matriz de um random walk de primeira ordem}}
  
-===== Equipe 7 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​mat.espacial.rConstrói a matriz de um CAR espacial}}
-  - Nayara Cavassim +
-  - Gislaine Aithma +
-  - Bruna Machado +
-{{:​pessoais:​wbonat:​v77n5a08.pdf|Artigo sugerido}}+
  
-===== Equipe 8 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​grp2sp.rConverte um arquivo da classe gpc para sp}}
-  - Camila Náter +
-  - Camila Ono +
-  - Bruna Larina +
-  - Andrieli Souza +
-  - Luiza Rasera +
-{{:​pessoais:​wbonat:​v79n5a13.pdf|Artigo sugerido}}+
  
-===== Equipe 9 ===== +{{:​pessoais:​wbonat:​voronoi.rConstrói uma tecelagem de Voronoi com base em um conjunto de coordenadas}}
-  - Fabiane +
-  - Marília Zaparolli +
-  - Caroline Benvenutti +
-  - Milena Ferrari +
-  - Paola Altheia +
-{{:​pessoais:​wbonat:​v81n5a08.pdf|Artigo sugerido}} +
- +
-===== Equipe 10 ===== +
-  - Ana Paula Rabuski +
-  - Marina Lissot +
-  - Franciele Bonfleur +
-  - Ariane Areda +
-  - Lais Fonseca +
-  - Douglas Rover +
-{{:​pessoais:​wbonat:​25523.pdf|Artigo sugerido}} +
- +
-===== Equipe 11 ===== +
-  - Carolina Pirobom +
-  - Antônia Cairassim +
-  - Camila Bao +
-  - Eliane +
-  - Daniele Ayres +
-{{:​pessoais:​wbonat:​31903.pdf|Artigo Sugerido}} +
- +
-===== Equipe 12 ===== +
-  - Monah Rosa +
-  - Thaís Zucarelli +
-  - Roberto Gregório +
-  - Henrique +
-{{:​pessoais:​wbonat:​18.pdf|Artigo sugerido}}+
    

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