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software:rcitrus [2007/01/08 15:30] elias |
software:rcitrus [2008/11/06 16:00] elias |
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| Linha 1: | Linha 1: | ||
| - | ===== Equipe ===== | + | ====== Rcitrus ====== |
| - | Elias e PJ | + | |
| + | Software para análise estatística de dados de incidência de doenças em plantas. | ||
| + | |||
| + | O Rcitrus é um disponibilizado na forma de um pacote (módulo adicional) para o R , que é uma línguagem e ambiente para computação estatística. | ||
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| + | \\ | ||
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| + | ===== Autores ===== | ||
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| + | [[http://www.leg.ufpr.br/~elias|Elias Teixeira Krainski]] - Estatístico (UFPR), Mestrando (UFMG) | ||
| + | [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo Justiniano Ribeiro Jr]] - professor do Departamento de Estatística da UFPR | ||
| + | |||
| + | Renato Beozzo Bassanezi - pesquisador do [[http://www.fundecitrus.com.br|Fundecitrus]] | ||
| ===== Resumo ===== | ===== Resumo ===== | ||
| Linha 16: | Linha 28: | ||
| Monte Carlo. Também foram implementados cinco métodos para simulação de | Monte Carlo. Também foram implementados cinco métodos para simulação de | ||
| dados binários com dependência espacial em lattices regulares. | dados binários com dependência espacial em lattices regulares. | ||
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| + | ==== Funcionalidades e métodos implementados ==== | ||
| + | |||
| + | - Leitura e escrita de dados em planilhas | ||
| + | - Conversores para classes de representação espaço temporal | ||
| + | - Validação de dados | ||
| + | - Análise por quadrat counts | ||
| + | - Análise de processos pontuais | ||
| + | - Modelo autologístico | ||
| + | - Simulação de dados com padrão espacial | ||
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| + | ===== Download e instalação ===== | ||
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| + | Para instalar o Rcitrus, há as seguintes DEPENDÊNCIAS: | ||
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| + | - A versão 2.5.0 do R, disponível no [[http://cran.r-project.org/|CRAN]]. | ||
| + | - Pacotes geoR, splancs e sp, disponíveis a partir do CRAN, em pacotes. Para instalá-los via internet diretamente da linha de comandos do R, pode-se utilizar os comandos: | ||
| + | * > install.packages("geoR") | ||
| + | * > install.packages("splancs") | ||
| + | * > install.packages("sp") | ||
| + | |||
| + | A instalação do Rcitrus pode ser feita seguindo os passos: | ||
| + | |||
| + | - Linux: O download pode ser feito do link: [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/Rcitrus_0.3-1.tar.gz|Rcitrus_0.3-1.tar.gz]] - código fonte e arquivos para instalação em ambiente Linux. | ||
| + | |||
| + | ** O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando: | ||
| + | |||
| + | * > install.packages("Rcitrus", contrib="http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus") | ||
| + | |||
| + | - Windows | ||
| + | O download pode ser feito do link: | ||
| + | |||
| + | [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows/Rcitrus_0.3-1.zip||Rcitrus_0.3-1.zip]] - arquivo de instalação para ambiente Windows. | ||
| + | |||
| + | O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando: | ||
| + | |||
| + | > install.packages("Rcitrus", contrib="http://leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows") | ||
| + | |||
| + | ===== Manuais ===== | ||
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| + | - Introdução ao Rcitrus [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/intro/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/intro/intro.pdf|pdf]] | ||
| + | - Trabalhando com dados de doenças de plantas em R [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/citrusData/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/citrusData/citrusData.pef|pdf]] | ||
| + | - Validação de dados de Citrus em R [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/valida/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/valida/valida.pdf|pdf]] | ||
| + | - Análise descritiva de dados de doenças de plantas com o Rcitrus [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/descritiva/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/descritiva/descritiva.pdf|pdf]] | ||
| + | - Análise por quadrat counts em R [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/quadrats/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/quadrats/quadrats.pdf|pdf]] | ||
| + | - Análise de processos pontuais em dados de Citrus [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/ppontuais/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/ppontuais/ppontuais.pdf|pdf]] | ||
| + | - Modelo autologístico [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/autologistic/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/autologistic/autologistic.pdf|pdf]] | ||
| + | - Simulação de dados de doenças em plantas [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/simula/|html]] [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus/simula/simula.pdf|pdf]] | ||
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| + | ===== Desenvolvimento ===== | ||
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| + | O Rcitrus foi desenvolvido no Laboratório de Estatística e Geoinformação [[http://www.leg.ufpr.br|(LEG)]], da Universidade Federal do Paraná. E parcialmente financiado pelo Fundo de Defesa da Citricultura [[http;//www.fundecitrus.com.br/|(FUNDECITRUS)]]. | ||
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| + | ===== Statistics ===== | ||
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| + | <html> | ||
| + | <a href="http://www4.clustrmaps.com/counter/maps.php?url=http://www.leg.ufpr.br/doku.php/software:Rcitrus" id="clustrMapsLink"><img src="http://www4.clustrmaps.com/counter/index2.php?url=http://www.leg.ufpr.br/doku.php/software:Rcitrus" style="border:0px;" alt="Locations of visitors to this page" title="Locations of visitors to this page" id="clustrMapsImg" onerror="this.onerror=null; this.src='http://www2.clustrmaps.com/images/clustrmaps-back-soon.jpg'; document.getElementById('clustrMapsLink').href='http://www2.clustrmaps.com';" /> | ||
| + | </a> | ||
| + | </html> | ||
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| ===== To Do ===== | ===== To Do ===== | ||
| Linha 23: | Linha 96: | ||
| - | ===== Links ===== | + | |
| - | - [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus|Página web do Rcitrus]] | + | |
