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--- software:rcitrus [2008/11/06 15:52]
elias
+++ software:rcitrus [2008/11/06 16:29]
paulojus
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 Software para análise estatística de dados de incidência de doenças em plantas.
-O Rcitrus é um disponibilizado na forma de um pacote (módulo adicional) para o R , que é uma línguagem e ambiente para computação estatística.
+O Rcitrus é um disponibilizado na forma de um pacote (módulo adicional) para o [[http://www.r-project.org|R]], que é uma linguagem e ambiente para computação estatística.
 \\
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 [[http://www.leg.ufpr.br/~elias|Elias Teixeira Krainski]] - Estatístico (UFPR), Mestrando (UFMG)
 [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo Justiniano Ribeiro Jr]] - professor do Departamento de Estatística da UFPR
-Renato Beozzo Bassanezi - pesquisador do [[http://www.fundecitrus.com.br|Fundecitrus]
+Renato Beozzo Bassanezi - pesquisador do [[http://www.fundecitrus.com.br|Fundecitrus]]
+===== Resumo =====
+Pacote em R para análise de dados de incidência de doenças em plantas. Seu
+desenvolvimento foi motivado pela necessidade de automatizar a análise
+estatística de dados de morte súbita dos citrus. Foram implementados alguns
+procedimentos para análise do padrão espacial da incidência
+de doenças em um talhão. Para a análise por quadrat counts,
+foram implementados os modelos de Poisson, binomial e beta-binomial, a lei
+de Taylor e dois procedimentos de seleção dos quadrats: sistemático ou aleatório.
+Para a análise por processos pontuais, foram adaptadas a técnica de
+suavização por kernel (simples e razão), a análise por vizinhos próximos e
+a função K de Ripley. Para a modelagem, foi implementado o modelo autologístico
+com inferência utilizando bootstrap via amostrador de Gibbs e o método de
+Monte Carlo. Também foram implementados cinco métodos para simulação de
+dados binários com dependência espacial em lattices regulares.
 ==== Funcionalidades e métodos implementados ====
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   - Simulação de dados com padrão espacial
-====  Download e instalação  ====
+=====  Download e instalação  =====
-Para instalar o Rcitrus, há as seguintes DEPENDÊNCIAS:
+===Dependências===
-    * A versão 2.5.0 do R, disponível no [[http://cran.r-project.org/|CRAN]].
+    - R, disponível no [[http://cran.r-project.org/|CRAN]].
-    * Pacotes geoR, splancs e sp, disponíveis a partir do CRAN, em pacotes. Para instalá-los via internet diretamente da linha de comandos do R, pode-se utilizar os comandos:
+    - Pacotes [[http://www.leg.ufpr.br/geoR|geoR]], splancs e sp, disponíveis a partir do CRAN, em pacotes. Para instalá-los via internet diretamente da linha de comandos do R, pode-se utilizar os comandos:
           * > install.packages("geoR")
           * > install.packages("splancs")
           * > install.packages("sp")
-A instalação do Rcitrus pode ser feita seguindo os passos:
+===Instalação em Linux/Windows===
+  * O download e instalação diretamente na linha de comandos do R é feita com o comando:<code R>
+> install.packages("Rcitrus", contrib="http://leg.ufpr.br/Rcitrus") </code>
-    * Para Windows, o download pode ser feito do link:
+  *O código fonte disponível para download:
+    * **[[http://leg.ufpr.br/Rcitrus/Rcitrus_0.3-1.tar.gz|Rcitrus_0.3-1.tar.gz]]**
-      [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows/Rcitrus_0.3-1.zip||Rcitrus_0.3-1.zip]] - arquivo de instalação para ambiente Windows.
+    * Binário para windows: **[[http://leg.ufpr.br/Rcitrus/windows/Rcitrus_0.3-1.zip|Rcitrus_0.3-1.zip]]**
-      O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando:
-      > install.packages("Rcitrus", contrib="http://leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows")
-    * Para Linux, o download pode ser feito do link:
-      [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/Rcitrus_0.3-1.tar.gz|Rcitrus_0.3-1.tar.gz]] - código fonte e arquivos para instalação em ambiente Linux.
-      O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando:
-      > install.packages("Rcitrus", contrib="http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus")
 ===== Manuais =====
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 =====  Desenvolvimento =====
-O Rcitrus foi desenvolvido no Laboratório de Estatística e Geoinformação [[http://www.leg.ufpr.br|(LEG)]], da Universidade Federal do Paraná. E parcialmente financiado pelo Fundo de Defesa da Citricultura [[http;//www.fundecitrus.com.br/|(FUNDECITRUS)]].
+O Rcitrus foi desenvolvido no Laboratório de Estatística e Geoinformação [[http://www.leg.ufpr.br|(LEG)]], da Universidade Federal do Paraná. E parcialmente financiado pelo Fundo de Defesa da Citricultura [[http://www.fundecitrus.com.br/|(FUNDECITRUS)]].
-===== Statistics =====
-<html>
-<a href="http://www4.clustrmaps.com/counter/maps.php?url=http://www.leg.ufpr.br/doku.php/software:art" id="clustrMapsLink"><img src="http://www4.clustrmaps.com/counter/index2.php?url=http://www.leg.ufpr.br/doku.php/software:art" style="border:0px;" alt="Locations of visitors to this page" title="Locations of visitors to this page" id="clustrMapsImg" onerror="this.onerror=null; this.src='http://www2.clustrmaps.com/images/clustrmaps-back-soon.jpg'; document.getElementById('clustrMapsLink').href='http://www2.clustrmaps.com';" />
-</a>
-</html>
-===== Resumo =====
-Pacote em R para análise de dados de incidência de doenças em plantas. Seu
-desenvolvimento foi motivado pela necessidade de automatizar a análise
-estatística de dados de morte súbita dos citrus. Foram implementados alguns
-procedimentos para análise do padrão espacial da incidência
-de doenças em um talhão. Para a análise por quadrat counts,
-foram implementados os modelos de Poisson, binomial e beta-binomial, a lei
-de Taylor e dois procedimentos de seleção dos quadrats: sistemático ou aleatório.
-Para a análise por processos pontuais, foram adaptadas a técnica de
-suavização por kernel (simples e razão), a análise por vizinhos próximos e
-a função K de Ripley. Para a modelagem, foi implementado o modelo autologístico
-com inferência utilizando bootstrap via amostrador de Gibbs e o método de
-Monte Carlo. Também foram implementados cinco métodos para simulação de
-dados binários com dependência espacial em lattices regulares.
-===== To Do =====
-===== Sugestões para o Rcitrus =====
-===== Links =====
-  - [[http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus|Página web do Rcitrus]]

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