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| [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo Justiniano Ribeiro Jr]] - professor do Departamento de Estatística da UFPR | [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo Justiniano Ribeiro Jr]] - professor do Departamento de Estatística da UFPR | ||
| - | Renato Beozzo Bassanezi - pesquisador do [[http://www.fundecitrus.com.br|Fundecitrus] | + | Renato Beozzo Bassanezi - pesquisador do [[http://www.fundecitrus.com.br|Fundecitrus]] |
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| + | ===== Resumo ===== | ||
| + | Pacote em R para análise de dados de incidência de doenças em plantas. Seu | ||
| + | desenvolvimento foi motivado pela necessidade de automatizar a análise | ||
| + | estatística de dados de morte súbita dos citrus. Foram implementados alguns | ||
| + | procedimentos para análise do padrão espacial da incidência | ||
| + | de doenças em um talhão. Para a análise por quadrat counts, | ||
| + | foram implementados os modelos de Poisson, binomial e beta-binomial, a lei | ||
| + | de Taylor e dois procedimentos de seleção dos quadrats: sistemático ou aleatório. | ||
| + | Para a análise por processos pontuais, foram adaptadas a técnica de | ||
| + | suavização por kernel (simples e razão), a análise por vizinhos próximos e | ||
| + | a função K de Ripley. Para a modelagem, foi implementado o modelo autologístico | ||
| + | com inferência utilizando bootstrap via amostrador de Gibbs e o método de | ||
| + | Monte Carlo. Também foram implementados cinco métodos para simulação de | ||
| + | dados binários com dependência espacial em lattices regulares. | ||
| ==== Funcionalidades e métodos implementados ==== | ==== Funcionalidades e métodos implementados ==== | ||
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| - Simulação de dados com padrão espacial | - Simulação de dados com padrão espacial | ||
| - | ==== Download e instalação ==== | + | ===== Download e instalação ===== |
| Para instalar o Rcitrus, há as seguintes DEPENDÊNCIAS: | Para instalar o Rcitrus, há as seguintes DEPENDÊNCIAS: | ||
| - | * A versão 2.5.0 do R, disponível no [[http://cran.r-project.org/|CRAN]]. | + | - A versão 2.5.0 do R, disponível no [[http://cran.r-project.org/|CRAN]]. |
| - | * Pacotes geoR, splancs e sp, disponíveis a partir do CRAN, em pacotes. Para instalá-los via internet diretamente da linha de comandos do R, pode-se utilizar os comandos: | + | - Pacotes geoR, splancs e sp, disponíveis a partir do CRAN, em pacotes. Para instalá-los via internet diretamente da linha de comandos do R, pode-se utilizar os comandos: |
| * > install.packages("geoR") | * > install.packages("geoR") | ||
| * > install.packages("splancs") | * > install.packages("splancs") | ||
| Linha 36: | Linha 51: | ||
| A instalação do Rcitrus pode ser feita seguindo os passos: | A instalação do Rcitrus pode ser feita seguindo os passos: | ||
| - | * Para Windows, o download pode ser feito do link: | + | - Linux: O download pode ser feito do link: [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/Rcitrus_0.3-1.tar.gz|Rcitrus_0.3-1.tar.gz]] - código fonte e arquivos para instalação em ambiente Linux. |
| - | [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows/Rcitrus_0.3-1.zip||Rcitrus_0.3-1.zip]] - arquivo de instalação para ambiente Windows. | + | ** O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando: |
| - | O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando: | + | * > install.packages("Rcitrus", contrib="http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus") |
| - | > install.packages("Rcitrus", contrib="http://leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows") | + | - Windows |
| + | O download pode ser feito do link: | ||
| - | * Para Linux, o download pode ser feito do link: | + | [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows/Rcitrus_0.3-1.zip||Rcitrus_0.3-1.zip]] - arquivo de instalação para ambiente Windows. |
| - | [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/Rcitrus_0.3-1.tar.gz|Rcitrus_0.3-1.tar.gz]] - código fonte e arquivos para instalação em ambiente Linux. | + | O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando: |
| - | O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando: | + | > install.packages("Rcitrus", contrib="http://leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows") |
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| - | > install.packages("Rcitrus", contrib="http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus") | + | |
| ===== Manuais ===== | ===== Manuais ===== | ||
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| - | ===== Resumo ===== | + | |
| - | Pacote em R para análise de dados de incidência de doenças em plantas. Seu | + | |
| - | desenvolvimento foi motivado pela necessidade de automatizar a análise | + | |
| - | estatística de dados de morte súbita dos citrus. Foram implementados alguns | + | |
| - | procedimentos para análise do padrão espacial da incidência | + | |
| - | de doenças em um talhão. Para a análise por quadrat counts, | + | |
| - | foram implementados os modelos de Poisson, binomial e beta-binomial, a lei | + | |
| - | de Taylor e dois procedimentos de seleção dos quadrats: sistemático ou aleatório. | + | |
| - | Para a análise por processos pontuais, foram adaptadas a técnica de | + | |
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| - | dados binários com dependência espacial em lattices regulares. | + | |
| ===== To Do ===== | ===== To Do ===== | ||
