Rcitrus

Software para análise estatística de dados de incidência de doenças em plantas.

O Rcitrus é um disponibilizado na forma de um pacote (módulo adicional) para o R , que é uma línguagem e ambiente para computação estatística.

Elias Teixeira Krainski - Estatístico (UFPR), Mestrando (UFMG) Paulo Justiniano Ribeiro Jr - professor do Departamento de Estatística da UFPR

Renato Beozzo Bassanezi - pesquisador do Fundecitrus] ==== Funcionalidades e métodos implementados ==== - Leitura e escrita de dados em planilhas - Conversores para classes de representação espaço temporal - Validação de dados - Análise por quadrat counts - Análise de processos pontuais - Modelo autologístico - Simulação de dados com padrão espacial ==== Download e instalação ==== Para instalar o Rcitrus, há as seguintes DEPENDÊNCIAS: * A versão 2.5.0 do R, disponível no [[http://cran.r-project.org/|CRAN.

• Pacotes geoR, splancs e sp, disponíveis a partir do CRAN, em pacotes. Para instalá-los via internet diretamente da linha de comandos do R, pode-se utilizar os comandos:
  • > install.packages("geoR")
  • > install.packages("splancs")
  • > install.packages("sp")

A instalação do Rcitrus pode ser feita seguindo os passos:

• Para Windows, o download pode ser feito do link:

    [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows/Rcitrus_0.3-1.zip||Rcitrus_0.3-1.zip]] - arquivo de instalação para ambiente Windows.

    O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando:

    > install.packages("Rcitrus", contrib="http://leg.est.ufpr.br/Rcitrus/windows")

• Para Linux, o download pode ser feito do link:

    [[http://www.leg.est.ufpr.br/Rcitrus/Rcitrus_0.3-1.tar.gz|Rcitrus_0.3-1.tar.gz]] - código fonte e arquivos para instalação em ambiente Linux.

    O download e a instalação diretamente na linha de comandos é feita com o comando:

    > install.packages("Rcitrus", contrib="http://www.leg.ufpr.br/Rcitrus") 

1. Introdução ao Rcitrus html pdf
2. Trabalhando com dados de doenças de plantas em R html pdf
3. Validação de dados de Citrus em R html pdf
4. Análise descritiva de dados de doenças de plantas com o Rcitrus html pdf
5. Análise por quadrat counts em R html pdf
6. Análise de processos pontuais em dados de Citrus html pdf
7. Modelo autologístico html pdf
8. Simulação de dados de doenças em plantas html pdf

O Rcitrus foi desenvolvido no Laboratório de Estatística e Geoinformação (LEG), da Universidade Federal do Paraná. E parcialmente financiado pelo Fundo de Defesa da Citricultura (FUNDECITRUS).

Pacote em R para análise de dados de incidência de doenças em plantas. Seu desenvolvimento foi motivado pela necessidade de automatizar a análise estatística de dados de morte súbita dos citrus. Foram implementados alguns procedimentos para análise do padrão espacial da incidência de doenças em um talhão. Para a análise por quadrat counts, foram implementados os modelos de Poisson, binomial e beta-binomial, a lei de Taylor e dois procedimentos de seleção dos quadrats: sistemático ou aleatório. Para a análise por processos pontuais, foram adaptadas a técnica de suavização por kernel (simples e razão), a análise por vizinhos próximos e a função K de Ripley. Para a modelagem, foi implementado o modelo autologístico com inferência utilizando bootstrap via amostrador de Gibbs e o método de Monte Carlo. Também foram implementados cinco métodos para simulação de dados binários com dependência espacial em lattices regulares.